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汕头大学海洋科学接受调剂
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

[交流] 【其他】在线答疑:VASP的问题

相应版主号召,特来开贴,我个人水平有限,所以在此抛砖引玉,标题虽是答疑,但是我觉得更应该是讨论。大家术业有专攻,VASP的每个方面不可能都掌握。所以,特开此贴,加强交流,望各位认识不认识的兄弟前来捧场,大家一起讨论,共同进步!

老帖地址(供大家参考)(九尾鱼):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=679096&fpage=1

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veryman

木虫 (正式写手)

$_$

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1,VIP+0):鼓励这样的提问,信息很详细 12-19 19:23
换新帖了啊,赶紧支持一下。
居然是传说中的沙发~~

问个问题吧,是NEB计算的。
我在INCAR中设置IMAGES=21,生成00-22共23个文件,但是为什么计算的时候给出来的却是:
00/POSCAR found :  3 types and   81 ions
17/POSCAR found :  3 types and   81 ions
然后只有01-16文件夹里有输出文件。
我特意换成IMAGES=15试了下,变成了
00/POSCAR found :  3 types and   81 ions
09/POSCAR found :  3 types and   81 ions
。。。

计算还没有完成,我想知道这是正常过程还是什么问题?

补个INCAR:
ISIF = 2
ISMEAR = 0
ISTART = 0
SIGMA = 0.2
NSW = 500
PREC = High
GGA = PE
LWAVE = .FALSE.
LCHARG = .FLASE.
EDIFF = 1E-6
EDIFFG =1E-6
IBRION = 1
NFREE = 2
IMAGES = 21
SPRING = -5
ICHAIN = 0
LCLIMB = .TRUE.

[ Last edited by veryman on 2009-12-18 at 16:41 ]
2楼2009-12-18 16:32:57
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by veryman at 2009-12-18 16:32:
换新帖了啊,赶紧支持一下。
居然是传说中的沙发~~

问个问题吧,是NEB计算的。
我在INCAR中设置IMAGES=21,生成00-22共23个文件,但是为什么计算的时候给出来的却是:
00/POSCAR found :  3 types and   8 ...

过渡态没搞过,需要很多结构是吧。
你用脚本搞的?
3楼2009-12-18 22:10:41
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

★ ★
aylayl08(金币+2,VIP+0):谢谢指点 12-19 19:23
引用回帖:
Originally posted by veryman at 2009-12-18 16:32:
换新帖了啊,赶紧支持一下。
居然是传说中的沙发~~

问个问题吧,是NEB计算的。
我在INCAR中设置IMAGES=21,生成00-22共23个文件,但是为什么计算的时候给出来的却是:
00/POSCAR found :  3 types and   8 ...

这个IMAGES参数我没用用过,是个不常用的参数。为此我找了一下说明书,个人感觉你对这个参数的理解好像有点问题,根据说明书上3.5.16的解释,这个IMGAES是和并行有关的一个参数

说明书上如是说
In this case each image, must run on one and only one node, the tag IMAGES must be set to the number of nodes:
IMAGES=number of nodes
也就是说要设置成节点的个数,所以和你理解的算几个文件好像没有关系吧
4楼2009-12-18 22:23:16
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veryman

木虫 (正式写手)

$_$

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1,VIP+0):鼓励发问 12-21 11:44
在说明书6.55上说,NEB计算的时候
IMAGES= number of images
应该没错吧

http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/node149.html
5楼2009-12-19 16:26:29
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ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)

好好总结,做个专题。
6楼2009-12-19 23:24:34
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

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zdhlover(金币+2,VIP+0):辛苦了 12-20 13:37
引用回帖:
Originally posted by veryman at 2009-12-19 16:26:
在说明书6.55上说,NEB计算的时候
IMAGES= number of images
应该没错吧

http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/node149.html

7楼2009-12-20 21:01:31
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2009-12-19 23:24:
好好总结,做个专题。

什么意思
8楼2009-12-20 21:01:57
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ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
哈哈,我在搜集素材。哈哈,想做个专题。拉拢人啊。
9楼2009-12-20 21:04:40
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):辛苦了 12-20 13:37
引用回帖:
Originally posted by veryman at 2009-12-19 16:26:
在说明书6.55上说,NEB计算的时候
IMAGES= number of images
应该没错吧

http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/node149.html

结合我得资料以及你给的资料,你看我们这样理解这个参数对不对。
这个参数将nodes分为几个组,每组处理一个IMGAGES,所以你设置的是有道理的。但是,这个是将nodes分为几组,比如你有10个IMAGES,那么你的nodes必须有10的整数倍,也就是10 20 或者30个。我觉得你好像没有考虑这个问题
10楼2009-12-20 21:08:40
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