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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 200金币求解析一个单晶
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席
引用回帖:
Originally posted by Leo7888 at 2009-12-16 19:36:
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       9.61 Ratio
这一条是说你的晶体结构里还存在非H分子，就是说你的结构没定完整，你找找Q峰，看看是不是哪个峰值比较高，估计是你的溶 ...

这个回答仿佛有问题噢，建议看一下iucr对此错误的说明
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谋事在人，成事在天
11楼2009-12-16 21:37:15
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)
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huangxc8687(金币+10,VIP+0):感谢参与，欢迎常来！！！ 12-17 09:14
qau204(金币+10,VIP+0): 12-17 18:17
qau204(金币+100,VIP+0): 12-22 08:48
Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       9.61 Ratio
H的Ueq太大. 要做统计分布处理. 或者用isor, simu命令处理
Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     230.00 A**3
还有些Q峰（可能是溶剂峰）没有指认
No su's on H-atoms, but refinement reported as .      mixed     
H原子缺su值，如果该H原子做过精修的话要su值。如果没有静修的话把cif中的Mixed
改成constr
No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........  
空间群没有给出来，按check结果填到CIF文件里就可以了
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12楼2009-12-16 21:41:36
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)
几个Alert level B问题caty的回答基本正确
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13楼2009-12-16 21:51:33
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
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qau204(金币+20,VIP+0):谢谢您 12-17 18:17
huangxc8687(金币+5,VIP+0):感谢参与！！！ 12-17 19:55
DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
             _refine_diff_density_max given =      0.968
            Test value =      0.800
密度测试值与计算值差别太大。应该也是文件没有处理的缘故。

PLAT094_ALERT_2_B Ratio of Maximum / Minimum Residual Density ....       4.03      
上面一个错误的继续

PLAT097_ALERT_2_B Large Reported Max.  (Positive) Residual Density       0.97 eA-3
上上面一个错误的继续



这个不是这样解释.
说的是Difference Fourier Map中的最大残余峰太高, 要加成原子的.
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xi2004-emuch@163.com
14楼2009-12-17 09:17:29
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huahua1216
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-12-17 09:17:
DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
             _refine_diff_density_max given =      0.968
            Test value =      0.800
密度测试值与计算值差别太大。应 ...

15楼2009-12-17 09:58:37
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Leo7888

银虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by caty at 2009-12-16 21:37:

这个回答仿佛有问题噢，建议看一下iucr对此错误的说明

哦，还真是有问题，，真是惭愧啊
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16楼2009-12-17 10:31:23
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yangping

木虫 (正式写手)
都是些小问题
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17楼2009-12-17 11:03:49
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
qau204(金币+10,VIP+0): 12-22 08:48
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-12-17 09:17:
DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
             _refine_diff_density_max given =      0.968
            Test value =      0.800
密度测试值与计算值差别太大。应 ...

这两个没有说清楚，应该是结构精修可能还有问题，参考xi的答案。
但是，差值傅立叶峰的异常不一定总是可以指认为原子，要视情况分析。

[ Last edited by caty on 2009-12-17 at 23:52 ]
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谋事在人，成事在天
18楼2009-12-17 23:49:52
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)
你的问题都解决了吗？论清楚了没有？
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19楼2009-12-23 11:01:54
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