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qau204

[交流] 200金币求解析一个单晶

一个纯有机单晶,基本结构已经解出来,就是有几个A,B类错误搞不定,求助高手帮忙,急着写文章,金币不多,愿全部奉送,谢谢了先
Alert level A
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       9.61 Ratio
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     230.00 A**3
PLAT093_ALERT_1_A No su's on H-atoms, but refinement reported as .      mixed     
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........  
Alert level B

DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
             _refine_diff_density_max given =      0.968
            Test value =      0.800
PLAT094_ALERT_2_B Ratio of Maximum / Minimum Residual Density ....       4.03      
PLAT097_ALERT_2_B Large Reported Max.  (Positive) Residual Density       0.97 eA-3
PLAT414_ALERT_2_B Short Intra D-H..H-X       H4     ..  H28C    ..       1.89 Ang.
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O4     -   H4     ...          ?

[ Last edited by qau204 on 2009-12-16 at 17:06 ]
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)

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huangxc8687(金币+10,VIP+0):感谢参与,欢迎常来!!! 12-17 09:14
qau204(金币+10,VIP+0): 12-17 18:17
qau204(金币+100,VIP+0): 12-22 08:48
Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       9.61 Ratio
H的Ueq太大. 要做统计分布处理. 或者用isor, simu命令处理
Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     230.00 A**3
还有些Q峰(可能是溶剂峰)没有指认
No su's on H-atoms, but refinement reported as .      mixed     
H原子缺su值,如果该H原子做过精修的话要su值。如果没有静修的话把cif中的Mixed
改成constr
No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........  
空间群没有给出来,按check结果填到CIF文件里就可以了
12楼2009-12-16 21:41:36
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xglegl

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sanko211(金币+2,VIP+0):谢谢参与 12-16 17:23
qau204(金币+5,VIP+0): 12-16 20:30
把数据帖出来啊 或者把错误贴出来啊
2楼2009-12-16 16:31:19
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sanko211(金币+1,VIP+0):谢谢参与 12-16 17:24
引用回帖:
Originally posted by xglegl at 2009-12-16 16:31:
把数据帖出来啊 或者把错误贴出来啊

yes
3楼2009-12-16 17:00:44
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xglegl

木虫 (正式写手)


eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 12-16 20:24
你的这些问题都能够解决的 你的Q峰还没有认定完呢 H4加错了
4楼2009-12-16 17:06:09
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