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yunyatou

金虫 (小有名气)

[交流] 紧急请教大家这个修稿意见怎么改啊??拜托虫友啦!

虫友帮忙看一下下面的问题咋解决啊  ,本人对这个晶体解析实在是外行,请大家指点一下,谢谢!
        好像是H的位置放的不对

The main concern is about amine H atom (H1), which is misplaced. The calculated position for that atom assumes a trigonal geometry for N1, although such N atom is almost certainly not planar. Indeed H1 may be found easily in a difference map and treated as a free atom (free coordinates and isotropic displacement parameter). Refinement including H1 with free coordinates converges to R1 = 3.6%, a 0.2% drop compared with your current refinement, and N1 is slightly tetrahedral, as expected. Finally, intramolecular H bond is more accurate after refining in that way. For instance, separation O...H is close to 1.92 A, significantly different from the separation observed in the current refinement (O...H: 2.09 A).
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brilliant

捐助贵宾 (职业作家)

★ ★
yunyatou(金币+1,VIP+0): 12-16 14:51
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 12-16 20:20
isotropic ,各向同性
4楼2009-12-16 14:50:15
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★
yunyatou(金币+1,VIP+0): 12-16 14:51
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 12-16 20:20
把N1的H1删掉 不要理论加 从q峰中很容易找到一个更加合理的 然后不用固定 各项异性精修~~

不知道是不是这样~
2楼2009-12-16 11:23:43
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