应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】如何固定某几个原子不动？
212/3返回列表上一页123下一页
查看: 9184  |  回复: 20
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢解惑 12-19 15:06
DLPOLY2 和DLPOLY3不存在谁的版本高的问题，它们可以看成是看上去很相似的两件软件，它们都在分别更新。它们的区别主要在于并行算法的设计。DLPOLY3是为了更大规模的计算而开发的。一般情况下，DLPOLY2就比较适用。
赞一下(10人) 回复此楼
11楼2009-12-19 09:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skfire

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
有人可以确切说明一下如何固定 dlpoly 的原子吗 ?
谢谢~~
赞一下(1人) 回复此楼
12楼2010-06-06 21:26:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-07 10:34:20
引用回帖:
Originally posted by skfire at 2010-06-06 21:26:50:
有人可以确切说明一下如何固定 dlpoly 的原子吗 ?
谢谢~~

FIELD文件中atoms 一栏中 令ifrz>0。谢谢。
赞一下(2人) 回复此楼
13楼2010-06-07 08:36:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skfire

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
感谢~~来尝试看看~~^^
赞一下(1人) 回复此楼
14楼2010-06-07 09:55:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skfire

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我把 field 文件 atom 一栏后面加  ifrz>0
结果似乎还是没能把分子固定住
-------------------------------------------------------
ATOMS     65    ifrz>0
-------------------------------------------------------
赞一下(1人) 回复此楼
15楼2010-06-08 09:49:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-08 12:09:13
引用回帖:
Originally posted by skfire at 2010-06-08 09:49:25:
我把 field 文件 atom 一栏后面加  ifrz>0
结果似乎还是没能把分子固定住
-------------------------------------------------------
ATOMS     65    ifrz>0
--------------------------------------- ...



哪有你那样写的。你看看Manual再写好不好。
赞一下(2人) 回复此楼
16楼2010-06-08 10:07:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skfire

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
manual 几行英文实在有点难懂~~?_?
麻烦老虎大能说明白些
我再继续尝试一下
成功再与各位分享~~^^
谢谢!!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
DL POLY 2 also allows atoms to be completely immobilised (i.e. “frozen” at a fixed point in theMD cell). This is achieved by setting all forces and velocities associated with that atom to zeroduring each MD timestep. Frozen atoms are signalled by assigning an atom a non-zero value forthe freeze parameter in the FIELD file. DL POLY 2 does not calculate contributions to the virialor the stress tensor arising from the constraints required to freeze atomic positions. In DL POLY 2the frozen atom option cannot be used for sites in a rigid body. As with the tethering potential,the reference position is scaled with the cell vectors in constant pressure simulations.In DL POLY 2 the frozen atom option is handled by the subroutine freeze.
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
赞一下(1人) 回复此楼
17楼2010-06-08 10:57:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-08 12:09:24
Please看看FIELD文件的写法。

ifrz是一个数，你设置它是一个大于0的数就可以了。
赞一下(2人) 回复此楼
18楼2010-06-08 11:03:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skfire

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
原来如此~~
我试看看~~
谢谢!!
赞一下(1人) 回复此楼
19楼2010-06-08 14:13:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiangtao9571

新虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-06-30 14:20:04
fix rigid 可以实现原子不动
引用回帖:
Originally posted by neweroica at 2009-12-14 23:54:27:
刚接触LAMMPS，有一个问题想请教大家：

我想在整个MD模拟过程中，固定某几个原子始终不动，请问该如何实现？ 具体用什么命令和关键词？  谢谢！！！

赞一下(1人) 回复此楼
20楼2010-06-30 12:43:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 neweroica 的主题更新
212/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 v7Aev8ORQjin 2026-08-22 3/150 2026-08-23 20:58 by 0p9y1isJp2jM
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 19:34 by lXgU0RvNTDC9
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 19:31 by lXgU0RvNTDC9
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 5/250 2026-08-23 18:55 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 4/200 2026-08-23 15:30 by KM5EcsNQRBPn
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 5/250 2026-08-23 12:09 by LR9qGULyN2ew
[基金申请] 什么时候开奖？ +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15 羊腰板 2026-08-21 16/800 2026-08-23 10:45 by process2012
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 10:44 by IXZuIJ2Q7OVy
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭