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一步一步

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】Gold对接后为什么打分值为负值啊?

有没有人用Gold对接打分出现负值啊??
我用小分子与蛋白质对接后出现负值,结构越复杂的越容易出现这种情况,有的甚至达到-800多。是不是小分子结构复杂了,小分子和蛋白质之间的结合作用太强的原因啊?还是有其他的原因?麻烦高手帮我分析一下。。。。谢了。。。
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nkyx

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★
一步一步(金币+1,VIP+0): 12-18 11:55
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-21 10:08
应该是碰撞很厉害吧
你看一下对接结果,是不是都对接进结合口袋了
或者看一下每一项的打分,看看哪一项比较负。
3楼2009-12-17 15:11:39
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iconsdkxq7

银虫 (小有名气)


一步一步(金币+1,VIP+0): 12-18 11:57
我也没用过,帮忙顶一下吧
2楼2009-12-16 12:11:59
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一步一步

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by nkyx at 2009-12-17 15:11:
应该是碰撞很厉害吧
你看一下对接结果,是不是都对接进结合口袋了
或者看一下每一项的打分,看看哪一项比较负。

应该都在结合口袋吧,因为主要的活性位点都对接上了。。。我看了一下,只要是结构复杂的,打分值都是负的,而且是负的好几百呢。。。目前在想简化一下结构,再对接一下看看。。。
4楼2009-12-18 11:57:37
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一步一步

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by iconsdkxq7 at 2009-12-16 12:11:
我也没用过,帮忙顶一下吧

谢谢!!
5楼2009-12-18 11:58:06
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