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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】Gold对接后为什么打分值为负值啊？
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一步一步

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】Gold对接后为什么打分值为负值啊？

有没有人用Gold对接打分出现负值啊？？
我用小分子与蛋白质对接后出现负值，结构越复杂的越容易出现这种情况，有的甚至达到-800多。是不是小分子结构复杂了，小分子和蛋白质之间的结合作用太强的原因啊？还是有其他的原因？麻烦高手帮我分析一下。。。。谢了。。。
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1楼 2009-12-14 14:47:53
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nkyx

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
一步一步(金币+1,VIP+0): 12-18 11:55
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-21 10:08
应该是碰撞很厉害吧
你看一下对接结果，是不是都对接进结合口袋了
或者看一下每一项的打分，看看哪一项比较负。
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3楼2009-12-17 15:11:39
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iconsdkxq7

银虫 (小有名气)
★
一步一步(金币+1,VIP+0): 12-18 11:57
我也没用过，帮忙顶一下吧
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2楼2009-12-16 12:11:59
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一步一步

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by nkyx at 2009-12-17 15:11:
应该是碰撞很厉害吧
你看一下对接结果，是不是都对接进结合口袋了
或者看一下每一项的打分，看看哪一项比较负。

应该都在结合口袋吧，因为主要的活性位点都对接上了。。。我看了一下，只要是结构复杂的，打分值都是负的，而且是负的好几百呢。。。目前在想简化一下结构，再对接一下看看。。。
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4楼2009-12-18 11:57:37
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一步一步

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by iconsdkxq7 at 2009-12-16 12:11:
我也没用过，帮忙顶一下吧

谢谢！！
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5楼2009-12-18 11:58:06
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