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shenxianshifu至尊木虫 (知名作家)
宗师
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【转帖】我国首次绘制完成大熊猫基因组精细图
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记者12月13日从国家林业局获悉，大熊猫基因组测序研究项目近日正式完成，并绘制出大熊猫基因组精细图。这是中国科学家第一次全面系统地对大熊猫基因组进行测序研究。 据介绍，大熊猫基因组测序研究结果表明，大熊猫有染色体21对，基因组大小2.4G，重复序列含量36%，基因2万多个。 这项研究由深圳华大基因研究院领衔，中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所、成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心共同参与。 研究结果还表明，大熊猫基因组仍然具备很高的杂合率和较高的遗传多态性；在已经进行全基因组测序的物种中，大熊猫基因组与狗的基因组最接近；数据分析结果同时还进一步支持了大多数科学家所持的“大熊猫是熊科的一个亚种”这种观点，证明了熊科内部各类群的分类情况。 据悉，大熊猫基因组精细图这一研究成果，填补了大熊猫基因组及分子生物学研究的空白，将从基因组学的层面上为大熊猫的保护、疾病监控及其人工繁殖提供科学依据。 http://www.sciencenet.cn/htmlnews/2009/12/226095.shtm |
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深圳华大基因中心（BGI-Shenzhen）联合了丹麦哥本哈根大学等国内外共25家单位，利用第二代测序技术，成功获得了大熊猫基因组序列草图,相关论文已于2009年12月13日在线发表于nature杂志上。研究人员组装的contig（2.25Gb）覆盖了约94％的全基因组，剩下的空隙(0.05Gb)似乎包含了食肉动物的特异重复和串联重复序列。通过与狗和人基因组的比较分析，表明大熊猫基因组具有较低的分歧等级。分析了其食性相关基因，表明其食物竹子相对于自身遗传组成，可能更多地依赖于其内脏微生物的分解。研究者从二倍体基因组中鉴别出了270万个杂合SNPs，其数据及分析为促进哺乳动物的遗传研究奠定了良好基础，也证明了利用第二代测序技术准确、低成本、快速高效组装真核大基因组的可行性。 目前大熊猫基因组数据已完全公开，可从BGI网站免费下载：http://panda.genomics.org.cn/download.jsp. 其数据包含了所有可用的reads、基因组组装、基因注释、重复和非编码RNA，以及杂合SNPs、indel、结构变异等方面。 |
5楼2009-12-29 20:32:45
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2楼2009-12-13 19:11:50
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3楼2009-12-13 23:04:20
laojiu9878
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4楼2009-12-14 08:31:19
