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shenxianshifu

至尊木虫 (知名作家)

宗师

[交流] 【转帖】我国首次绘制完成大熊猫基因组精细图

记者12月13日从国家林业局获悉,大熊猫基因组测序研究项目近日正式完成,并绘制出大熊猫基因组精细图。这是中国科学家第一次全面系统地对大熊猫基因组进行测序研究。

据介绍,大熊猫基因组测序研究结果表明,大熊猫有染色体21对,基因组大小2.4G,重复序列含量36%,基因2万多个。

这项研究由深圳华大基因研究院领衔,中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所、成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心共同参与。

研究结果还表明,大熊猫基因组仍然具备很高的杂合率和较高的遗传多态性;在已经进行全基因组测序的物种中,大熊猫基因组与狗的基因组最接近;数据分析结果同时还进一步支持了大多数科学家所持的“大熊猫是熊科的一个亚种”这种观点,证明了熊科内部各类群的分类情况。

据悉,大熊猫基因组精细图这一研究成果,填补了大熊猫基因组及分子生物学研究的空白,将从基因组学的层面上为大熊猫的保护、疾病监控及其人工繁殖提供科学依据。
http://www.sciencenet.cn/htmlnews/2009/12/226095.shtm
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09021122

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
大熊猫的全基因组已经出来了  我们中国人的全基因组什么时候出来呢?
雄关漫道真如铁,而今迈步从头越
2楼2009-12-13 19:11:50
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brassica227

铁虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 09021122 at 2009-12-13 19:11:
大熊猫的全基因组已经出来了  我们中国人的全基因组什么时候出来呢?

不早就出来了吗? 炎黄一号
3楼2009-12-13 23:04:20
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laojiu9878

至尊木虫 (知名作家)

九牛


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
大熊猫的全基因组出来了,现在基因组测序越来越容易,
但愿人长久
4楼2009-12-14 08:31:19
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osbrk

金虫 (正式写手)

附上文章,以供学习


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
深圳华大基因中心(BGI-Shenzhen)联合了丹麦哥本哈根大学等国内外共25家单位,利用第二代测序技术,成功获得了大熊猫基因组序列草图,相关论文已于2009年12月13日在线发表于nature杂志上。研究人员组装的contig(2.25Gb)覆盖了约94%的全基因组,剩下的空隙(0.05Gb)似乎包含了食肉动物的特异重复和串联重复序列。通过与狗和人基因组的比较分析,表明大熊猫基因组具有较低的分歧等级。分析了其食性相关基因,表明其食物竹子相对于自身遗传组成,可能更多地依赖于其内脏微生物的分解。研究者从二倍体基因组中鉴别出了270万个杂合SNPs,其数据及分析为促进哺乳动物的遗传研究奠定了良好基础,也证明了利用第二代测序技术准确、低成本、快速高效组装真核大基因组的可行性。
   目前大熊猫基因组数据已完全公开,可从BGI网站免费下载:http://panda.genomics.org.cn/download.jsp. 其数据包含了所有可用的reads、基因组组装、基因注释、重复和非编码RNA,以及杂合SNPs、indel、结构变异等方面。
破茧成蝶
5楼2009-12-29 20:32:45
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