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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】amorphous cell构建模型问题
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xmuyjm

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】amorphous cell构建模型问题

单链构建与多链构建的区别？大多论文采用单链单分子构建模型计算，但是如果要考虑实际的平均分子量，然后又要构建足够大的cell，就需要多链构建amorphous cell，不知道多链构建的模型会有些什么问题呢？谢谢。
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1楼 2009-12-13 17:13:51
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judy1931

铜虫 (小有名气)
★
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楼主说的好像不是太清楚，你用amorphous cell来建了模型是干嘛的呀？
不过我也没用过amorphous cell来构建过模型，除了在MD中建水盒子及油盒子，在这个过程中也要区分单链和多链吗？我好像从来都没有注意过这个问题
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2楼2009-12-14 08:54:54
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xmuyjm

金虫 (初入文坛)
我是用来做有机聚合物结构模拟的，不知道跟您的这种无机分子有没有区别。单链分子量大概在1000左右，体系为无定形，所以用amorphous cell来构建模型。谢谢您的回复！
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3楼2009-12-14 09:35:32
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weijianming

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
按照实际的平均分子量构建的话，比如SBS，分子量就要10几万，那样计算量太大了啊。
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4楼2009-12-14 09:55:01
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★ ★
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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 12-16 14:07
看你的样子好像是要算聚合物吧？你要是想用这个模块构建混合分子量的体系几乎几乎是不可能的。。。
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2009-12-14 22:07:01
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