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xinying7006木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助/交流】未知序列如何测得基因全长?如何从全长中筛选目的基因
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| 对研究对象的基因测序背景一无所知,目的基因序列未知,想得到其全长并分析基因表达情况及功能,请各位高手不吝赐教,十分感谢 感谢~~~ |
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你的问题好笼统,一般情况是将你要做的东西,丢到ncbi里面进行搜索,然后收集序列,最好选择与你做的基因的来源亲缘关系近的物种,选择出来后在ncbi中进行blast进行比对,然后找到保守序列,设计简并引物,可以从基因组中扩增也可以从rna进行扩增,如果扩增的得到的不是全基因序列,可以用walking等方法扩增得到全基因序列。得到序列后你就可以进行转化表达,分析功能了 如果你的东西DNA水平的同源性比较低的话,就要多找很多序列进行分析,然后找到比较保守的block区域。可以用codehop在线网站进行block的寻找和简并引物的设计 |
2楼2009-12-11 18:13:50
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