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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助成功】装过sybyl8.0的专业人士帮忙解释一句话
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CADD

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助成功】装过sybyl8.0的专业人士帮忙解释一句话

启动sybyl8.0时,运行完许可证服务器后(我没设置环境变量)出现了这么一句话:
    "Using customized SYBYL settings contained in:/home/yjs/.sybylrc"
这句话应该怎么理解呀?我应该怎么启动sybyl呀?

[ Last edited by CADD on 2009-12-27 at 12:47 ]
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1楼 2009-12-10 14:30:59
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javacfish

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 14:31
就是说，你自定义的设置包含在/home/yjs/.sybylrc这个文件中
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2楼2009-12-10 20:13:09
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CADD

银虫 (正式写手)
麻烦您说详细一点可以吗?那我怎么启动sybyl啊?很急,请您指点一下.谢谢
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3楼2009-12-11 08:19:04
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loappleve

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
怎么启动license的，怎么运行sybyl的
请把命令写出来

[ Last edited by loappleve on 2009-12-11 at 09:39 ]
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4楼2009-12-11 09:38:02
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CADD

银虫 (正式写手)
好的,我先谢谢你了.

开始时这样的:
运 行cd /home/yjs/AdminTools10.8/bin/linux  
   再./lmgrd triposlm
这里应该是正常的.(license using TC port-14000,大概是这样的)
接下来:cd /home/yjs/sybyl8.0 回车
      ./bin/linux/sibyl 回车后
      Using terminal type “OGLX
      SYBYL8.0 (linux_os2z) Greated Nov 29.2007
      Copyright 1991-2007 Tripos,Ine.All Right Reserved.
      This material contains confidential and proprietary information of tripos,Irc,furnished under license agreement. This material maybe used or copied,only in accordance with the terms of the agreement. Molucular silverware copyright(c) 1990 Rhon and Hoas company. .All Right Reserved
      17:56:02 (triposlm) CUT :SYBYL8” yjs@localhost.localdomain.
      17:56:02 (triposlm) CUT :”CPU” yjs@localhost. localdomain.
      17:56:02 (triposlm) CUT :”SybylBasic” yjs@localhost. localdomain.
      " NOTICE:If you want to customize SYBYL Settings ,place them in the file “/home/yjs/.sybylrc”that you creaded.   “   
Using default SYBYL Settings insdead.
      17:56:03(triposlm) CUT:”XDEV” yjs@localhost. localdomain.   
      17:56:04 (triposlm) IN:”SYBYL8” yjs@localhost. localdomain.
      17:56:04 (triposlm) IN: ”CPU” yjs@localhost. localdomain.
      17:56:04 (triposlm) IN: ”SybylBasic” yjs@localhost. localdomain.
      17:56:04 (triposlm) IN: ”XDEV” yjs@localhost. localdomain.
   
后来:
我在/home/yjs/下建了一个".sybylrc"的文件,再输入export PATH=$PATH /tripos/sybyl8.0/trigo/
运 行cd /home/yjs/AdminTools10.8/bin/linux  
   再./lmgrd triposlm
接下来:cd /home/yjs/sybyl8.0 回车
      ./bin/linux/sibyl 回车后
      Using terminal type “OGLX
      SYBYL8.0 (linux_os2z) Greated Nov 29.2007
      Copyright 1991-2007 Tripos,Ine.All Right Reserved.
      This material contains confidential and proprietary information of tripos,Irc,furnished under license agreement. This material maybe used or copied,only in accordance with the terms of the agreement. Molucular silverware copyright(c) 1990 Rhon and Hoas company. .All Right Reserved
      17:56:02 (triposlm) CUT :SYBYL8” yjs@localhost.localdomain.
      17:56:02 (triposlm) CUT :”CPU” yjs@localhost. localdomain.
      17:56:02 (triposlm) CUT :”SybylBasic” yjs@localhost. localdomain.
      "Using customized SYBYL settings contains contained in :/home/yjs/.sybylrc”
      17:56:03(triposlm) CUT:”XDEV” yjs@localhost. localdomain.   
      17:56:04 (triposlm) IN:”SYBYL8” yjs@localhost. localdomain.
      17:56:04 (triposlm) IN: ”CPU” yjs@localhost. localdomain.
      17:56:04 (triposlm) IN: ”SybylBasic” yjs@localhost. localdomain.
      17:56:04 (triposlm) IN: ”XDEV” yjs@localhost. localdomain.
  就这样了,sybyl的图形界面闪了一下,就变成上面的样子了.麻烦您帮忙看一下.
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5楼2009-12-11 09:50:44
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loappleve

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 12-16 14:32
开始时这样的:
运 行cd /home/yjs/AdminTools10.8/bin/linux  
   再./lmgrd triposlm
这里应该是正常的.(license using TC port-14000,大概是这样的)
接下来:cd /home/yjs/sybyl8.0 回车
      ./bin/linux/sibyl 回车后
________________
到这里，sybyl正常启动了吗？

————————————————————————
后来:
我在/home/yjs/下建了一个".sybylrc"的文件,再输入export PATH=$PATH /tripos/sybyl8.0/trigo/
运 行cd /home/yjs/AdminTools10.8/bin/linux  
   再./lmgrd triposlm
——————————————————————
这里你设置了环境变量，启动sybyl时候 直接输入sybyl8.0 是不是可以直接启动了？
另外，你用的好像是bash，建议用cshell 我在用suflexdock模块时候bash可能会有问题。
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6楼2009-12-12 10:59:09
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CADD

银虫 (正式写手)
sybyl的界面只是闪了一下,不能正常启动,我现在愁的就是这个.
设置完环境变量后,输入sybyl8.0时出现了"command not found".
"你用的好像是bash，建议用cshell 我在用suflexdock模块时候bash可能会有问题."什么意思?是要换系统吗?
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7楼2009-12-13 09:22:45
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loappleve

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 14:32
开始时这样的:
运 行cd /home/yjs/AdminTools10.8/bin/linux  
   再./lmgrd triposlm
这里应该是正常的.(license using TC port-14000,大概是这样的)
接下来:cd /home/yjs/sybyl8.0 回车
      ./bin/linux/sibyl 回车后
————————————————————————
这里sybyl也没有正常启动吗，只是闪了一下？
cshell可以在用户管理中更改不用重装系统，这个等正常启动以后再说吧
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8楼2009-12-13 10:16:25
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CADD

银虫 (正式写手)
对呀
"开始时这样的:
运 行cd /home/yjs/AdminTools10.8/bin/linux  
   再./lmgrd triposlm
这里应该是正常的.(license using TC port-14000,大概是这样的)
接下来:cd /home/yjs/sybyl8.0 回车
      ./bin/linux/sibyl 回车"

我输入上面的命令后就没有反应了,sybyl不能正常启动,自从装上以后,就一直是这样的.进不了sybyl的界面.每次输入完命令后,都只是闪一下.不知道问题出在哪.
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9楼2009-12-13 16:25:29
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loappleve

金虫 (小有名气)
★
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我判断不出来原因了 如果licence启动没问题，不用设置其他的应该就可以直接启动了，抱歉帮不了你
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10楼2009-12-14 14:23:57
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