| 查看: 589 | 回复: 5 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】MS中怎样打开Linux下的轨迹文件
|
|||
|
我在Linux下做过渡态和frequencies,把完成后所有的文件传输到window下的MS中，我怎样才能打开轨迹文件？怎样才能分析频率？还有做过渡态时我若在MS里编辑好input文件，直接run可以正常计算，若是files,在linux下做过渡态，为什么不生成*.xcd和*_hist.xtd文件哪位大侠指点一下，不胜感激 [ Last edited by luyongan12 on 2009-12-14 at 10:02 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有7人回复
-
申请2026年博士
已经有5人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有5人回复
-
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有6人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有7人回复
-
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有6人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有7人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有4人回复
-
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
6楼2009-12-14 12:18:44
goodtimega
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 8138.7
- 散金: 570
- 红花: 1
- 帖子: 1489
- 在线: 527.5小时
- 虫号: 820248
- 注册: 2009-08-02
- 专业: 高分子材料结构与性能
2楼2009-12-12 01:07:20
Joannaouc
木虫 (著名写手)
- 应助: 46 (小学生)
- 贵宾: 2.2
- 金币: 1686.5
- 散金: 894
- 红花: 10
- 帖子: 1262
- 在线: 266.1小时
- 虫号: 305787
- 注册: 2006-12-10
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+2,VIP+0):谢谢指点 12-12 19:52
luyongan12(金币+1,VIP+0):好 12-14 09:44
luyongan12(金币+4,VIP+0):非常感谢 12-18 12:03
aylayl08(金币+2,VIP+0):谢谢指点 12-12 19:52
luyongan12(金币+1,VIP+0):好 12-14 09:44
luyongan12(金币+4,VIP+0):非常感谢 12-18 12:03
|
你是用dmol算的不？打开*.outmol，再打开*.xsd，然后点dmol->analyse->frequency就可以了。其他的类似 ---------------------------------------------------------- 抱歉  回答的时候凭印象了。我自己又重新做了一遍，确实是需要在tools->vibrational analysis->calculate里面打开，可以看到各个频率及其强度。 在standalone模式下面就是你说的用linux算是不会生成*.xcd之类的分析文件的，需要用*.outmol，然后使用dmol->analysis来生成。 举个例子如果想生成* Energies.xcd和* Convergence.xcd（这个在你机器上跑的时候是自动生成的），就需要先打开*.outmol，再打开*.xsd,dmol->analysis->Energy evolution->file就可以了。 ----------------------------------------------------------- 再加一点，如果是standalone模式跑出来的结果，需要生成*.xcd后手动导入相关的hessian，才能够分析频率。 导入的方法如下：edit->insert from->*.hessian 然后再打开vibrational analysis就可以calculate了 P.S.算energy得到的hessian不可以用来做频率分析，只有算frequency得到的单点能才可以。 [ Last edited by Joannaouc on 2009-12-18 at 09:43 ] |
3楼2009-12-12 11:20:53
4楼2009-12-14 09:48:07