24小时热门版块排行榜    

查看: 916  |  回复: 3
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 fmj121 的 6 个金币

fmj121

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于DOCK报错

之前用dock一直很好,今天偶然发现一个问题,就是在sphgen这一步出现如下错误:
fmt: read unexpected character
apparent state: unit 2 named temp2.sph
last format2I5,F8.4,I8,4F12.6)
lately reading sequential formatted external IO
Aborted


不知道是哪里出问题,希望高人指导!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

javacfish

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
fmj121(金币+2,VIP+0): 12-14 09:59
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 有无兴趣来本版兼职啊 呵呵 12-16 14:12
你的蛋白文件太大,超过了99999,你可以截取你感兴趣的部分进行对接。用chemria即可。
如果你问,截取的蛋白之后,蛋白就不完整了,怎么办,其实对接的时候蛋白是固定的,你也是选择特定范围对接的,与你去除的那部分无关。

对接成功后,在用整个蛋白和配体进行分析,这样是允许的。

如果你觉得麻烦建议用autodock.

如果你有任何问题,请到这里问,我会统一回答:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1699900

具体原因,我也在一楼提起过。你仔细看看。

[ Last edited by javacfish on 2009-12-10 at 20:24 ]
2楼2009-12-10 20:20:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

javacfish

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
fmj121(金币+2,VIP+0): 12-14 10:54
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 14:12
1.主要原因不是电荷的问题,是蛋白太大了。电荷归零在用chimera处理的最后一步就归零了。

2.对,就是这样的
3楼2009-12-14 10:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fmj121

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by javacfish at 2009-12-14 10:25:
1.主要原因不是电荷的问题,是蛋白太大了。电荷归零在用chimera处理的最后一步就归零了。

2.对,就是这样的

谢谢了!
4楼2009-12-14 10:54:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fmj121 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考研] 化学调剂0703 +7 啊我我的 2026-03-11 7/350 2026-03-15 23:03 by 凌千颂111
[考研] 274求调剂 +4 时间点 2026-03-13 4/200 2026-03-15 15:29 by Rambo13
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy! 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 一志愿安徽大学材料工程专硕313分,求调剂的学校 +8 Yu先生 2026-03-10 10/500 2026-03-14 01:04 by JourneyLucky
[考研] 312求调剂 +6 陌宸希 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:40 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分,求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 285化工学硕求调剂(081700) +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +3 大口吃饭 身体健 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:31 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿河海大学085900土木水利专硕279求调剂不挑专业 +4 SunWwWwWw 2026-03-10 8/400 2026-03-13 02:23 by SunWwWwWw
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
[考研] 0856材料与化工353分求调剂 +11 NIFFFfff 2026-03-09 11/550 2026-03-10 18:36 by suyuanhai
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
信息提示
请填处理意见