24小时热门版块排行榜    

查看: 1010  |  回复: 3
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 fmj121 的 6 个金币

fmj121

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于DOCK报错

之前用dock一直很好,今天偶然发现一个问题,就是在sphgen这一步出现如下错误:
fmt: read unexpected character
apparent state: unit 2 named temp2.sph
last format2I5,F8.4,I8,4F12.6)
lately reading sequential formatted external IO
Aborted


不知道是哪里出问题,希望高人指导!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

javacfish

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
fmj121(金币+2,VIP+0): 12-14 09:59
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 有无兴趣来本版兼职啊 呵呵 12-16 14:12
你的蛋白文件太大,超过了99999,你可以截取你感兴趣的部分进行对接。用chemria即可。
如果你问,截取的蛋白之后,蛋白就不完整了,怎么办,其实对接的时候蛋白是固定的,你也是选择特定范围对接的,与你去除的那部分无关。

对接成功后,在用整个蛋白和配体进行分析,这样是允许的。

如果你觉得麻烦建议用autodock.

如果你有任何问题,请到这里问,我会统一回答:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1699900

具体原因,我也在一楼提起过。你仔细看看。

[ Last edited by javacfish on 2009-12-10 at 20:24 ]
2楼2009-12-10 20:20:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

javacfish

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
fmj121(金币+2,VIP+0): 12-14 10:54
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 14:12
1.主要原因不是电荷的问题,是蛋白太大了。电荷归零在用chimera处理的最后一步就归零了。

2.对,就是这样的
3楼2009-12-14 10:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fmj121

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by javacfish at 2009-12-14 10:25:
1.主要原因不是电荷的问题,是蛋白太大了。电荷归零在用chimera处理的最后一步就归零了。

2.对,就是这样的

谢谢了!
4楼2009-12-14 10:54:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fmj121 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +13 koalala 2026-08-24 15/750 2026-08-24 13:04 by lugia2
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 18/900 2026-08-24 12:03 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +12 kulium 2026-08-21 15/750 2026-08-24 12:02 by iaeyuan
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 明天应该可查了!? +4 chengyan1220 2026-08-23 4/200 2026-08-24 08:47 by gloomy6159
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见