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davidck金虫 (正式写手)
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[交流]
【求助/交流】关于细胞内信号分子的作用方式
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大家说说细胞内信号分子的作用方式吧... 我现在做的是原核生物，以枯草芽孢杆菌为模式生物，在做一些关于细胞内的一些小的关于biofilm形成的signal，及其pathway 前面一个毕业生的课题中指出一个蛋白，具有两种调控方式，一个方式是作为激酶，另一个方式未明，也就是我现在做的方向。 问题是，他指出具有另一个调控功能的区域大概只有20个氨基酸，而且是固定在膜上，大家觉得有可能通过什么方式在起作用呢？ 我现在做pull down，希望能发现一些能与之结合的蛋白，但是感觉希望好小，同时老板也在让我做一些有可能与之作用的downstream的信号蛋白的突变体，来碰，看是不是通过其来发生作用，这种方式也很盲目啊... 大家有什么好的想法没有，关键我是觉得这个功能域太小了，才20个AA，而且是固定在膜上的，能怎样的发生作用啊，唉~~~~~~~ |
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davidck(金币+3,VIP+0):谢啦，这可能是一个方面，另一方面，我们想做的是想知道关于这个小尾巴的和分泌蛋白无关的功能。。 12-18 04:17
davidck(金币+3,VIP+0):谢啦，这可能是一个方面，另一方面，我们想做的是想知道关于这个小尾巴的和分泌蛋白无关的功能。。 12-18 04:17
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原来不是激酶。 我觉得你说的“小尾巴”有两种可能功能。 第一种：信号肽酶的跨膜区域嵌在膜里，如果没有某种固定机制，就会随着细胞膜的运动而到处漂流，而不能在适当的地点发挥作用。那个小尾巴可能将信号肽酶固定到一个特定区域，这个区域汇集了核糖体以及分泌蛋白转运元件。小尾巴也可能直接和核糖体互作，把它牵引过来，以使得分泌蛋白能在这个区域表达。 第二种：小尾巴是直接和分泌蛋白作用的，只有当小尾巴和分泌蛋白前体结合，将其拉进到信号肽酶，才能够将其信号肽切除，将分泌蛋白释放。分泌蛋白正确地被释放，就有效地参与到胞外生物膜的合成当中去。 这样的Pull-down应该比较好做。甚至你不妨自己表达一些潜在的互作蛋白（核糖体、分泌蛋白、信号肽、分泌蛋白转运相关蛋白）来验证。 [ Last edited by 叔扬 on 2009-12-14 at 10:01 ] |
7楼2009-12-14 09:55:55
qiang84zhang
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2楼2009-12-08 09:30:08
davidck
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3楼2009-12-10 08:44:59
davidck
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是不是嫌弃金币太少了？4楼2009-12-11 07:20:46