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davidck

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[交流] 【求助/交流】关于细胞内信号分子的作用方式

大家说说细胞内信号分子的作用方式吧...
我现在做的是原核生物，以枯草芽孢杆菌为模式生物，在做一些关于细胞内的一些小的关于biofilm形成的signal，及其pathway

前面一个毕业生的课题中指出一个蛋白，具有两种调控方式，一个方式是作为激酶，另一个方式未明，也就是我现在做的方向。
问题是，他指出具有另一个调控功能的区域大概只有20个氨基酸，而且是固定在膜上，大家觉得有可能通过什么方式在起作用呢？

我现在做pull down，希望能发现一些能与之结合的蛋白，但是感觉希望好小，同时老板也在让我做一些有可能与之作用的downstream的信号蛋白的突变体，来碰，看是不是通过其来发生作用，这种方式也很盲目啊...

大家有什么好的想法没有，关键我是觉得这个功能域太小了，才20个AA，而且是固定在膜上的，能怎样的发生作用啊，唉~~~~~~~

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1楼2009-12-08 05:07:17

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davidck

金虫 (正式写手)

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楼上兄台的建议令我收益良多啊，谢谢先

不过，可能是我没有把问题说清楚，我再说具体点，希望还能得到些帮助：
我的目的蛋白是typeI signal peptidase，其这个方面的功能已经研究的很清楚了，其功能域在胞外的一个酶活中心里；但是我们同时发现了其另外一个独立的功能，这个功能也清楚了，是与biofilm形成中的sruface-adhere有关，然后就是我前面说的，通过构建不同的突变体，竟然发现这个调控功能的区域存在于胞内的一个小尾巴上，也就是我说的那20个氨基酸，现在对于这20个大小的小东西的作用方式很是奇怪：固定在胞内，没有三级结构（也就说，”可能“不具备任何酶活），那它能以什么形式发生作用呢？

需要注意的是，这个20aa的调控作用与其peptidase作用是相互独立，这个是已经被证明了的，当然，说实话，我也没法完全保证其调控作用是完全的基于这20个aa，头疼ing

大家见过有什么作用方式能适用于这么小的固定的蛋白序列么？

[ Last edited by davidck on 2009-12-12 at 07:49 ]