| 查看: 2050 | 回复: 8 | |||||
| 当前主题已经存档。 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
wfbgc木虫 (小有名气)
|
[交流]
【讨论】[img][img]论tanloer虫友关于用origin画MS电子密度等高线图之错误与遗漏[/img
|
||||
|
前不久，一位叫tanloer的虫友发了一个叫“MS电荷密度在Origin中作图方法，http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1627651”的帖子，本人非常感兴趣，按照tanloer来画图，发现，tanloer的方法有很大的问题或者说是遗漏。因此，本人特发帖与大家一起讨论。 首先需要描述一下castep中输出的电子密度文件：*.charg_frm。用写字板或origin打开后会发现有三例：a,b,c,charge。分别对应于x,y,z三个轴和电子密度。 用tanloer的方法是固定某一个轴的分量，使之为常数。例如(100)以及与之平等的面。余下两个轴为变量，组成一个面，再用 origin中的contour模块来画电子密度图。对于(100),(010),(001)面等，这种方法是可行的，但是对于不能用两个变量描述的平面，这种方法是不可行的。 origin中的contour模块简单介绍： origin中的contour模块是用一个二维数组描述一个平面，即用x,y轴来描述平面。用Z轴来描述平面上某点P(x,y)对应的一个值。使用这个模块必须明确，x,y是用来确定点的位置，Z是这个点的值。画电子密度的等高线的平面图的关键是如何确定平面。 (100)面上任一点的坐标为A(1,y,z)。y，z 的取值从理论上可以从负无穷到正无穷，但考虑一个晶胞，y，z的取值应从0取到1.由于，A点的取值在x轴上永远为1，为一定值，所以可以用一个二维空间的平面来描述三维空间中平面，即用两个变量描述一个平面。就此可以用origin中的contour模块来画出(100),(010),(001)面的电子密度分布。 对于（110），（111）面而言，平面上的任一点A(x,y,z)在三个轴上不再是一定值，就此必须用三个变量描述一个平面，此时，origin中的contour模块不再适用。 对于如何在origin里用三个变量来描述一个平面的问题，我一直没想到好的办法，希望大家能一起思考这个问题，如果谁解决了这个问题，请与广大虫友分享。 当然我发这个帖子绝对没有针对tanloer的意思，只是想把问题提出来，供大家一起来讨论。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Photochemistry | 学习 |
» 猜你喜欢
极限拉扯，如何抉择
已经有15人回复
-
申请科研项目纯靠实力能成功吗？
已经有8人回复
-
中科院海洋所招收海洋材料相关领域博士研究生及研究助理
已经有4人回复
-
40+中年人失业后，还能找到好工作吗？
已经有3人回复
-
二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores
已经有4人回复
-
OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？
已经有13人回复
-
课题组会帮你通过考核么？
已经有7人回复
-
入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有10人回复
aylayl08
荣誉版主 (文坛精英)
至尊天蝎
- 1ST强帖: 1
- 应助: 3 (幼儿园)
- 贵宾: 4.825
- 金币: 19183.7
- 散金: 2180
- 红花: 34
- 沙发: 48
- 帖子: 16357
- 在线: 824.1小时
- 虫号: 533169
- 注册: 2008-03-26
- 专业: 无机非金属基复合材料
- 管辖: 量子化学
4楼2009-12-05 16:31:52
wfbgc
木虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1802.1
- 散金: 10
- 红花: 2
- 帖子: 220
- 在线: 172小时
- 虫号: 448198
- 注册: 2007-11-01
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
3楼2009-12-04 01:03:28
6楼2009-12-06 20:18:22
yindeqiang
银虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 6560.8
- 散金: 4212
- 红花: 6
- 沙发: 2
- 帖子: 588
- 在线: 441.1小时
- 虫号: 731244
- 注册: 2009-03-25
- 性别: GG
- 专业: 固体力学
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+5,VIP+0):谢谢讨论，很有意义 1-21 10:10
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+5,VIP+0):谢谢讨论，很有意义 1-21 10:10
|
对于如何在origin里用三个变量来描述一个平面的问题，我一直没想到好的办法，希望大家能一起思考这个问题，如果谁解决了这个问题，请与广大虫友分享。 我们最终要做出的是某个面的“电荷密度图”，所以我觉得三个变量（不知道楼主说的是不是空间点的位置xyz？）还是可以转换成两个变量的问题，例如我们选择了（110），那么我们选择电荷密度文件：*.charg_frm中，（110）所对应的abc charge，然后选择 b c charge 或者a c charge这三个量做出tanloer 所描述的图（因为a，b的值是把空间按格点分割成多少等份，它把（110）的底边分成了相应的等份），应该就可以了吧？ 不知道这种做法可行否，请朋友们指正 |
7楼2009-12-07 09:57:00
200
