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陈思容

铜虫 (正式写手)

[交流] PCR高手请进,有问题求教,急!

师姐要做菌种鉴定,用真菌的通用引物ITS1、ITS4,P出来很诡异的结果:本来是在500-700之间出现单一的条带,可是在2000-1000之前出现了弥散状条带,TD-PCR,普通PCR的结果都是如此,实在没辙了,师姐很崩溃,我也很郁闷!条件、反应体系都是我帮她设的,经过前人的验证没有问题,师姐自己加的样,想不明白问题到底出在那个环节,还希望各位高手赐教!

本帖关键词:PCR 真菌 师姐 菌种 引物
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陈思容

铜虫 (正式写手)

在线等,不要沉了
2楼2009-12-03 11:04:44
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
是不是基因组提的不好,里面还含有杂蛋白,导致出现弥散状条带?
3楼2009-12-03 11:30:37
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陈思容

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhuifeng7000 at 2009-12-3 11:30:
是不是基因组提的不好,里面还含有杂蛋白,导致出现弥散状条带?

应该不是杂蛋白的问题,还有没有其他的可能?
4楼2009-12-03 11:50:59
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一只鱼ddtt

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+4,VIP+0): 12-3 22:35
你这个真菌是不是比较特殊,我最近细菌鉴定时也出现这样的问题,本该出现一条带,结果出现了意想不到的几条,体系和条件也是别人验证过的,后来做了细菌涂布纯化,发现该菌有三种不同的形态,但绝不是被污染了,老师说有可能是一个菌的多种形态,也可能是复合菌株,所以我建议你用普通的方法先鉴定一下你的菌,不行就切胶回收测序。
做个有风度的人
5楼2009-12-03 14:48:49
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陈思容

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 一只鱼ddtt at 2009-12-3 14:48:
你这个真菌是不是比较特殊,我最近细菌鉴定时也出现这样的问题,本该出现一条带,结果出现了意想不到的几条,体系和条件也是别人验证过的,后来做了细菌涂布纯化,发现该菌有三种不同的形态,但绝不是被污染了,老 ...

谢谢,P出来时一片弥散的条带,特异性不高,尝试加DMSO等增加特异性的东西吧
6楼2009-12-03 16:50:52
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陈思容

铜虫 (正式写手)

amisking(金币+0,VIP+0):恭喜,解除置顶! 12-3 22:36
先在这里谢谢大家了,我们终于P出来了,56°退火温度,关键的是加入DMSO,这大概是增加了特异性吧,说不清楚,反正出来的条带很漂亮!再次谢谢大家
7楼2009-12-03 19:32:13
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