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【求助】关于gaussian结构的查找
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现在的学习基本处于停滞的阶段，因为不知道怎们找化学物质的键长、键角、二面角。原来有问过，说有《兰氏手册》，下了粗劣看了下，只有键长。说可以查文献，得是就像找论文一样。例如：我找2，6-DNT，多数论文都有涉及，但很少涉及 那么详细的结构参数。请各位高手指点一下！ |
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liujodan
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9楼2009-12-03 13:24:58
yjcmwgk
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（1）这个东西是ccdc能查 我已经替你查出来了 在附件里，是个cif文件，包含两个晶体 如果你不了解晶体，你找个懂晶体的同学，帮你测量这个cif文件中的两个晶体，各个键长键角二面角都能测量 （2）文献的正文中，确实很少提供详细的结构参数。详细的结构参数往往在SI的cif中 （3）http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1577069 如果你想学习如何查cif，你可以看看这个帖子的第三章第一个教程 如果你想学习如何从cif中获得详细的结构参数，你可以看看这个帖子的第三章第二个教程 （4）我想已经没有遗漏的事情了吧，学去吧，呵呵 [ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-30 at 20:29 ] |
2楼2009-11-30 20:23:05
abbott
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3楼2009-11-30 21:07:10
zhangmt
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算分子找结构，当然是有文献的找文献，或者从数据库中去搜。如版主说的，这些结构数据通常在文献的support information中去找。 没有文献以及数据库中也没有的，那就自己来画个大概的，就用gview默认的去画就好——当然会有几个看来都比较合理的异构体或不同构象，那就分别优化，选定能量最低的那个。 如果有文献或数据库中的结构，也要把那个结构做初始结构，再去优化一下。如果优化的结果跟实验结构很接近，说明你的算法和基组合理，你可以继续做设想中的其他计算了，比如找过渡态之类的，如果结构数据相差比较多，就要考虑自己的算法和基组在哪里不大合理了，要重新修改算法或者基组。 否则你计算的其他数据同样不可信。 [ Last edited by yjcmwgk on 2009-12-3 at 16:40 ] |
5楼2009-12-01 12:37:42