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gwdavid木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
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[交流]
【求助】gromacs中的rlist应该设置多大合适?
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我的蛋白模拟体系,正方体水盒子,边长7.7nm,用PME来计算静电作用。 可是我当我的mdp 文件中rlist分别设0.8 nm, 1.0 nm, 1.2nm, 1.4nm时(因为PME要求rcouloumb=rlist,因此rcouloumb也要设相同的值),得到的Coul-SR项都不相等,这样怎么办?到底应该取什么值?哪一个准确? |
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