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xtdut

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】g09中连续计算的命令行如何写？

在g09的用户手册和例子中经常看到是一个简单的分子（比如水、乙烷等）优化构型，接着计算单点能什么的。我的问题是：这两步计算是共用一个分子说明部分，还是第一步计算的结果作为第二步计算的分子说明部分？如果我想将第一步计算的结果作为第二步计算的分子说明部分，第二步计算结果作为第三步的分子说明部分，第三步计算结果作为第四步计算的分子说明部分，并且每一步计算中的电荷数和自旋多重度要自己定义，每一步的计算结果都要写在输出文件中（也就是.log中）以方便最后使用gview查看结果，命令行应该如何写？同时如何用gview查看每一步的计算结果也是个问题？另外，听人说g09不稳定，这种连续计算要是中间某一步出错，整个计算就会终止，如何避免？希望大家能够耐心点给出命令行的写法及注意事项，不要一个--link1--命令行就了事，其实这里面有很多说道及注意事项的，用户手册和例子中也没有明确地说明，需要大家给出自己的使用心得与经验，谢谢大家！

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1楼2009-11-29 09:22:34

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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xtdut(金币+2,VIP+0):受教了，其实我也不想用--link1--的，只是换用服务器后，计算速度加快了，有时候晚上算完了，机器就白白地开着，得等到第二天早晨上班了才能接着计算下一步任务，感觉浪费了很多时间，所以才有这么一问，总之要感谢您的回复！ 11-29 11:45
yjcmwgk(金币+5,VIP+0): 11-30 14:17

我的经验和心得：
1、能不用--link1--尽量不用。能分开操作尽量分开操作。高斯计算不是递交一大堆任务等着算，而是每一步结果都要分析过程、确认结论，必要时还要监控执行的过程，然后再安排下一步工作。
2、没有g09，所以只以g03为例说一下，特定的、极其简单的例子，可以用--link1--的时候，用geom=check或者geom=allcheck，无论用哪个都是共用分子坐标的，而且都是用前一个结果做为下一个的起始点的。区别在于前者自己必须重新写电荷和多重度，后者不能自己再写电荷和多重度。
3、guess=read经常与上面两个连用，用来直接读取上一步的结果做为初始猜，可以加速计算。
4、没有搞过把一大堆任务放在一起的经验，怎么用gview看不同部分的结果不知道（纳闷了，谁会没事做这种事？）
5、我想不仅g09，其他版本应该都是一步做错了，后续的就没价值了。避免的办法就是根本不要用--link1--这类命令把本该分开一步步完成的工作放在一起。其他比如即使502不收敛也要继续做下去，可以用iop(5/13=1)等内部选项来调整。但不建议这样用，因为没有科研价值。
6、用高斯是搞科研的，把精力多放在结果分析、实验安排上，少在一些奇淫技巧上做手脚，下功夫。