| 查看: 242 | 回复: 2 | ||
| 当前主题已经存档。 | ||
z6242948木虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】如何限制蛋白质中的部分残基
|
|
|
最近看了篇文献 想用amber照着跑个动力学 但文献中给位于配体分子15埃之外的蛋白质残基加了约束2kcal/mo.k 现在不知道使用什么具体的命令来加这个约束，restraint应该不行 不知道15埃是用什么命令规定的？希望各位大虾帮帮忙 谢谢 [ Last edited by z6242948 on 2009-11-27 at 15:12 ] |
回复此楼
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
2楼2009-11-27 11:02:53
z6242948
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2444.5
- 红花: 1
- 帖子: 80
- 在线: 57.6小时
- 虫号: 517295
- 注册: 2008-03-03
- 专业: 理论和计算化学
3楼2009-11-27 15:11:52
50