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【求助】有机复合物的结构初始模型
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我现在做一个有机酸对有机胺生成的有机盐的复合物,希望先用对接的方法得到一个初始结构,再后面结合实验测试数据进行解析。 使用AUTODOCK才刚开始,对结果输入不是太确定。 请教-我希望在对接完后,可以测量官能团间、酸碱原子间的距离、夹角等几何参数,最好能够拿到整个复合物的原子坐标。据说,autodock设计为-大分子不动,也不输出其原子坐标。 这个复合物的坐标在模拟过程中肯定是有的,但该怎么获得? [ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:48 ] |
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