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风吹沙起

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[交流] 分子胶：给蛋白质“牵线搭桥”的新一代药物

从一场“意外”说起
20 世纪 50 年代上市的沙利度胺，曾因严重的致畸副作用成为医药史上最著名的悲剧药物；但几十年后，它和它的“后代”来那度胺却摇身一变，成为治疗多发性骨髓瘤的重磅药物。科学家直到 2010 年代才弄清它们真正的作用方式：这些分子并不直接“攻击”任何蛋白，而是像一小滴胶水，把两个原本互不相干的蛋白质粘在一起——“分子胶”（Molecular Glue）由此得名，并成为当今靶向蛋白降解领域最炙手可热的概念之一。
什么是分子胶？
传统小分子药物的思路是“堵枪眼”：找到致病蛋白上的活性口袋，把小分子塞进去，抑制它的功能。问题在于，人体里大量致病蛋白（例如许多转录因子）表面光滑平整，根本没有可供结合的“口袋”，长期被贴上“不可成药”的标签。
分子胶换了一条路：它不去抑制蛋白，而是改变蛋白的“社交关系”——诱导两个原本不会结合的蛋白相遇，借助细胞自身的机制完成治疗。它是“事件驱动”而非“占据驱动”的：只需要促成一次相遇，剩下的交给细胞。
它是怎么起作用的？
目前最主流的一类分子胶叫分子胶降解剂，它劫持的是细胞里一套天然的“垃圾回收系统”——泛素-蛋白酶体系统。整个过程可以分成四步：
第一步：粘住“质检员”。细胞里有一种叫 E3 泛素连接酶的蛋白复合物，职责是给“该报废的蛋白”贴上泛素标签，好比垃圾回收站的质检员。分子胶先结合到 E3 上，并悄悄改变它表面的形状，“捏”出一个全新的结合界面。
第二步：钓来“新底物”。这个被重塑的界面，恰好能识别并结合一个本来与该 E3 毫不相干的蛋白——也就是我们想要清除的致病蛋白（称为“新底物”）。三者形成“E3–分子胶–靶蛋白”三元复合物。
第三步：贴上“销毁标签”。靶蛋白被拉到 E3 身边后，E3 把一串串泛素分子转移到它表面。多聚泛素链在细胞里就是明确的“销毁”信号。
第四步：送入“粉碎机”。细胞的蛋白酶体识别泛素标签，把靶蛋白彻底降解成碎片。
最精妙的是：分子胶自己不会被消耗。降解完一个靶蛋白，它脱身出来继续催化下一轮。这种“催化型”作用意味着很低的剂量就能持续清除致病蛋白——这正是它区别于传统抑制剂的核心优势。

图 1 分子胶降解剂的作用机理示意图
分子胶 vs. PROTAC：殊途同归的两兄弟
分子胶常被拿来和另一项明星技术 PROTAC 比较。二者都能诱导蛋白降解，但路线不同：

简单说：PROTAC 像一条两端带钩子的绳子，按图索骥；分子胶像一小滴化学胶水，精巧却难以设计。
为什么这么难找？AI 能帮上什么忙？
分子胶的最大瓶颈是发现难：它创造的蛋白界面在自然界原本不存在，无法从已知结构推演；它对单个蛋白的亲和力可能弱到测不出，只有三者同时在场才“显灵”；而且分子上细微的改动就会彻底改变它降解的对象，脱靶风险高。目前已知的分子胶，几乎都是“先发现药效、后搞清机制”的意外之喜。
这正是 AI 制药（AIDD）跃跃欲试的战场：
•配对预测：扫描人体约 600 种 E3 连接酶与疾病靶点，预测哪些“组合”存在可成胶的界面；
•三元复合物建模：用 AlphaFold3 类结构预测和分子动力学模拟，虚拟搭建“E3–胶–靶蛋白”复合物，评估可行性；
•生成式化学设计：以来那度胺等已知骨架为起点，用生成模型改造出能诱导新底物降解的新分子；
•降解谱预测：用大规模蛋白组学数据训练模型，预测一个分子“会误伤哪些蛋白”，提前规避毒性。
行业里的共识是：算法正在趋同，真正的护城河是专有的、大规模的蛋白降解数据。因此领先公司普遍采用“AI 预测 → 高通量实验验证 → 数据回流训练模型”的闭环打法。
现状与展望
除了已上市的来那度胺等药物，全球已有多款分子胶进入临床，主要集中在肿瘤领域；近两年的大额药企合作（如诺华、礼来、吉利德的相关交易）也把这个赛道推向免疫炎症等更广阔的疾病领域。科学家们还在探索非降解型分子胶——用“胶水”稳定或增强有益的蛋白相互作用，治疗方向从“拆”扩展到“补”。
回望历史，分子胶的故事颇具戏剧性：一类偶然被发现的老药，揭示了一种全新的药物作用范式。而今天的研究者正试图把这份“运气”变成“工程”——用 AI 和高通量实验，系统性地设计出下一个分子胶。谁能率先把“偶然”变成“必然”，谁就可能打开数以百计“不可成药”靶点的大门。

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1楼 2026-11-07 23:36:53

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xiaoqiuqiu202楼

2026-11-07 23:53 回复

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