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jason897铜虫 (正式写手)
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[交流]
(求助)一些C类错误，实在搞不定了，不解决还不行，只好来求助
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(求助)一些C类错误，实在搞不定了，不解决还不行，只好来求助 我的一个数据，氢键加好后出现好多C类错误，因为错误太多，一定要解决。否则没法投。 PLAT222_ALERT_3_C Large Non-Solvent H Ueq(max)/Ueq(min) ... 3.27 Ratio PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Ni2 -- N16 .. 5.14 su PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Mo1 -- C17 .. 8.03 su PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Mo1 -- C19 .. 7.72 su PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Mo1 -- C23 .. 7.99 su PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Mo1 -- C24 .. 8.10 su PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Mo1 -- C30 .. 8.55 su PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Mo1 -- C31 .. 7.33 su PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Mo1 -- C33 .. 6.90 su PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X) Mo1 -- C37 .. 9.75 su PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor N4 - H4A ... ? PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor N12 - H12B ... ? PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor N13 - H13A ... ? PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor N13 - H13B ... ? PLAT068_ALERT_1_C Reported F000 Differs from Calcd (or Missing)... ? --------------------------------------------------------------------------------Alert level G PLAT860_ALERT_3_G Note: Number of Least-Squares Restraints ....... 1 G类错误可能是我删了三个较长的典型氢键引起的。 |
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jason897(金币+1,VIP+0):谢谢！LST中有些氢键就是没有受体原子的，是什么原因造成的？ 11-22 20:34
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 11-22 21:12
jason897(金币+1,VIP+0):谢谢！LST中有些氢键就是没有受体原子的，是什么原因造成的？ 11-22 20:34
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 11-22 21:12
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H原子我不知道你是如何确定的，理论？ 找到？ 如果是理论他的Ueq是-1.5 -1.2 还是例如0.08 ？ 0.06？等等。 建议：限定一下H的Ueq 例如10.08. PLAT230 Type_2 Hirshfeld Rigid-Bond Test (Acta Cryst (1976),A32,239-244 -------------------------------------------------------------------------------- The components of the anisotropic displacement parameters along chemical bonds are assumed to be equal in magnitude. Large differences supposedly indicate contamination of these parameters with other (unresolved) effects such as (substitutional) disorder, model or data errors and/or over refinement. Atomic sites assigned the wrong scattering type (e.g. Ag versus Br) should generate 'problem signals' with this test. Data sets corrected for absorption effects with DELREF techniques (e.g. DIFABS, SHELXA, XABS2) often show large DELU values for bonds involving the heaviest atom. Note: The original 'Hirshfeld-test' was defined in absolute terms (see F.L.Hirshfeld, Acta Cryst. (1976). A32, 239-244). The current test is with reference to the associated standard uncertainty. 第二类问题， 我不知道不太熟悉，你自己读一下，看看是对应什么问题，我认为与Mo原子的半径大有关。 参考。 420 显然是你做h-bond的时候有错误，没有受体。 检查一下lst 和res ins有否错误。 仅供参考 |
2楼2009-11-22 10:12:50
li_junxia6281
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3楼2009-11-22 11:14:03
paopaomeng
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4楼2009-11-22 12:15:11
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5楼2009-11-22 19:37:59
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7楼2009-11-22 21:10:15
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8楼2009-11-26 08:46:46
9楼2009-11-28 09:30:18
jason897
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10楼2009-11-28 15:46:29