应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » (求助)一些C类错误，实在搞不定了，不解决还不行，只好来求助
101/1返回列表
查看: 824  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 jason897 的 7 个金币

jason897

铜虫 (正式写手)

[交流] (求助)一些C类错误，实在搞不定了，不解决还不行，只好来求助

(求助)一些C类错误，实在搞不定了，不解决还不行，只好来求助

我的一个数据，氢键加好后出现好多C类错误，因为错误太多，一定要解决。否则没法投。
PLAT222_ALERT_3_C Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       3.27 Ratio
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Ni2    --  N16     ..       5.14 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Mo1    --  C17     ..       8.03 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Mo1    --  C19     ..       7.72 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Mo1    --  C23     ..       7.99 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Mo1    --  C24     ..       8.10 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Mo1    --  C30     ..       8.55 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Mo1    --  C31     ..       7.33 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Mo1    --  C33     ..       6.90 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Mo1    --  C37     ..       9.75 su   
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor       N4     -   H4A    ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor       N12    -   H12B   ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor       N13    -   H13A   ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor       N13    -   H13B   ...          ?      
PLAT068_ALERT_1_C Reported F000 Differs from Calcd (or Missing)...          ?
--------------------------------------------------------------------------------Alert level G
PLAT860_ALERT_3_G Note: Number of Least-Squares Restraints .......          1     

G类错误可能是我删了三个较长的典型氢键引起的。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-11-22 09:59:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jehugu

★ ★
jason897(金币+1,VIP+0):谢谢！LST中有些氢键就是没有受体原子的，是什么原因造成的？ 11-22 20:34
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 11-22 21:12
H原子我不知道你是如何确定的，理论？ 找到？ 如果是理论他的Ueq是-1.5 -1.2 还是例如0.08 ？ 0.06？等等。 建议：限定一下H的Ueq 例如10.08.


PLAT230 Type_2 Hirshfeld Rigid-Bond Test (Acta Cryst (1976),A32,239-244
--------------------------------------------------------------------------------

The components of the anisotropic displacement parameters along chemical
bonds are assumed to be equal in magnitude. Large differences supposedly
indicate contamination of these parameters with other (unresolved) effects
such as (substitutional) disorder, model or data errors and/or
over refinement. Atomic sites assigned the wrong scattering type (e.g. Ag
versus Br) should generate 'problem signals' with this test. Data sets
corrected for absorption effects with DELREF techniques (e.g. DIFABS, SHELXA,
XABS2) often show large DELU values for bonds involving the heaviest atom.
Note: The original 'Hirshfeld-test' was defined in absolute terms (see
F.L.Hirshfeld, Acta Cryst. (1976). A32, 239-244). The current test is with
reference to the associated standard uncertainty.


第二类问题， 我不知道不太熟悉，你自己读一下，看看是对应什么问题，我认为与Mo原子的半径大有关。 参考。

420 显然是你做h-bond的时候有错误，没有受体。 检查一下lst 和res ins有否错误。

仅供参考
赞一下(12人) 回复此楼
2楼2009-11-22 10:12:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

li_junxia6281

木虫 (著名写手)
好难呀！顶贴！！！
回复此楼
3楼2009-11-22 11:14:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paopaomeng

铁杆木虫 (著名写手)
★
jason897(金币+1,VIP+0):版主，不要再说了，投E有时候真不是自己所愿。要是老板就让你发一篇正经文章，后面就拖着你从高往低试，我不投E咋毕业呀 11-22 20:37
哎，又是投e吧，不投e根本不用改
赞一下(2人) 回复此楼
经历了“删除门”，有点晕！
4楼2009-11-22 12:15:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongyang5028

金虫 (正式写手)
ACTA E，不是没有A类错误就可以的么？
赞一下 回复此楼
5楼2009-11-22 19:37:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jason897

铜虫 (正式写手)
★
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 11-22 20:56
引用回帖:
Originally posted by jehugu at 2009-11-22 10:12:
H原子我不知道你是如何确定的，理论？ 找到？ 如果是理论他的Ueq是-1.5 -1.2 还是例如0.08 ？ 0.06？等等。 建议：限定一下H的Ueq 例如10.08.


PLAT230 Type_2 Hirshfeld Rigid-Bond Test (Acta Cryst (1976 ...

H原子一些是直接HADD加的，还有水氢是用HFIX 加的，还有用Q峰加的。Ueq值我真没注意。一会看看。
赞一下(10人) 回复此楼
6楼2009-11-22 20:42:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
jason897(金币+1,VIP+0):谢谢XI老师，本来想短消息问您的，怕您忙，就赖这里发帖请大家帮忙。那么对于C和N统计问题该如何解决？删掉重算后再加再算吗？ 11-22 21:54
我觉得大部分根源在与CN中C和N的统计。
不知道我猜得可对？
赞一下(2人) 回复此楼
xi2004-emuch@163.com
7楼2009-11-22 21:10:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jason897

铜虫 (正式写手)
再次感谢XI老师！
回复此楼
8楼2009-11-26 08:46:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zlygdppla

新虫 (初入文坛)

用什么命令怎么限制或固定水上的Ｈ?

H原子我不知道你是如何确定的，理论？ 找到？ 如果是理论他的Ueq是-1.5 -1.2 还是例如0.08 ？ 0.06？等等。 建议：限定一下H的Ueq 例如10.08.

请问用什么命令命令来限制水上的Ｈ。是加在res文件上吗
赞一下 回复此楼
9楼2009-11-28 09:30:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jason897

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zlygdppla at 2009-11-28 09:30:
H原子我不知道你是如何确定的，理论？ 找到？ 如果是理论他的Ueq是-1.5 -1.2 还是例如0.08 ？ 0.06？等等。 建议：限定一下H的Ueq 例如10.08.

请问用什么命令命令来限制水上的Ｈ。是加在res文件上吗

一个可以再XP中用HADD 2,来加，第二个再RES中可以用AFIX 23 命令来加，但是一般还要删掉来重加。用Q峰加也是很好的办法。这个参见XI老师的帖子
赞一下 回复此楼
10楼2009-11-28 15:46:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jason897 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭