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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】高对称性分子的优化问题已有1人参与

如果有一个分子是高对称性的,比如苯(D6h),我在GV中是把它设为C1再优化,还是用D6h优化,或者用D6h优化,再降低对称性优化?不懂,请教高手
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★ ★ ★ ★
loovfnd(金币+1,VIP+0):说的不错 11-20 20:56
yjcmwgk(金币+3):我个人不喜欢nosymm。近来越来越喜欢symm(pg=?) 2010-04-02 09:17
对称性越高,计算越方便,速度越快。所以从效率上讲,只要你确信结果应该是具有你确信的对称性,就在gview里用严格标准修订一次坐标——当然,gview判断是一回事,gaussian判断又是一回事,你可以在gaussian跑完202以后看看gaussian的判断结果。但是gaussian默认会一直保持这个对称性不变,如果优化过程中发生对称性被破坏,它会报错的。所以,如果你不确认维持对称性能得到稳定点,就可以手工输入nosymm来取消对称性限制,但这样计算效率肯定会大打折扣的。好处是可以更保险的得到稳定点。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2009-11-20 20:41:25
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zpppanda111

金虫 (小有名气)

★ ★
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yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-21 12:21
你既然知道了它的对称性,就在这一对称性下优化,这样算出的结果也更符合。
如果不知道对称性就不需要考虑那么多了,要保证的是优化后的结构是能量最低点即可
3楼2009-11-21 10:18:31
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阿司

金虫 (小有名气)


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引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2009-11-20 20:41:25:
对称性越高,计算越方便,速度越快。所以从效率上讲,只要你确信结果应该是具有你确信的对称性,就在gview里用严格标准修订一次坐标——当然,gview判断是一回事,gaussian判断又是一回事,你可以在gaussian跑完2 ...

想请教一下,我优化+频率计算一组分子,其中有几个分子因为有很强的对称性,所以算的时候老是出错,所以我取消对称性后,可以算的出来了。
     可是我想问的是:因为其它分子已经算出来了,并没有nosymm,而其中的几分子nosymm了,使用nosymm对会影响计算结果的Mulliken Charge和Molecular Orbital Coefficients吗?
简单而不忘努力就好
4楼2010-04-01 20:55:13
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

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aylayl08(金币+2):谢谢讨论交流 2010-04-03 08:11
引用回帖:
Originally posted by 阿司 at 2010-04-01 20:55:13:

      想请教一下,我优化+频率计算一组分子,其中有几个分子因为有很强的对称性,所以算的时候老是出错,所以我取消对称性后,可以算的出来了。
     可是我想问的是:因为其它分子已经算出来了,并没有nosym ...

如果你对自己算的分子的对称性非常明确的话,最好在Z矩阵里设置好了,就让程序保持这个对称性去算。当然,你如果不确定的话,一是可以加nosymm,二是直接用直角坐标优化也可。

[ Last edited by qzhaosdu on 2010-4-2 at 02:43 ]
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2010-04-02 02:41:33
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wtscrystal

银虫 (小有名气)


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引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2010-04-02 02:41:33:

如果你对自己算的分子的对称性非常明确的话,最好在Z矩阵里设置好了,就让程序保持这个对称性去算。当然,你如果不确定的话,一是可以加nosymm,二是直接用直角坐标优化也可。

[ Last edited by qzhaosdu on ...

这个我感兴趣,也就是如果分子是对称的用Z矩阵加对称限制计算会快很多, 而直角坐标则慢,或会出错. 那对于C3的对称性,是不是GAUSSIAN只算其中的三分之一的分子,C3V的则只算六分之一的分子?  是不是这样?
6楼2010-04-02 07:37:59
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zpppanda111

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
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aylayl08(金币+2):谢谢讨论交流 2010-04-03 08:12
如果知道对称性进行优化,计算速度会快些
你也可以采用高斯默认的形式进行优化,最重要的是计算结果中没有虚频,
因为计算过程中对称性可能发生变化
7楼2010-04-02 10:43:39
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dukelr

金虫 (小有名气)


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我觉得如果分子有确定的对称性的时候 那么对称性里面设置相应的对称性和设置为nosymm应该是一样的
8楼2010-04-15 19:36:09
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