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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 如何正确利用Gaussian来计算纤维素和染料分子之间的分子间作用力呢？
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202220164333

新虫 (初入文坛)
已领完
如何正确利用Gaussian来计算纤维素和染料分子之间的分子间作用力呢？
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我现在研0，暑假提前进组，我以前是学软件工程的，最后调剂到纺织工程，现在导师让我做一些化学计算方面的内容，我已经学习过了华算科技的Gaussian入门级课程，知道如何求一些小分子之间的分子间作用力，我也尝试通过用chemdraw画有三四个基础结构的纤维四糖线性结构，接着通过chem3D来转换为3D，在用mm2力场优化一下，我给我老师看了之后，她说太紧凑了，没有柔性，基组和方法我一时半会不知道选择什么，有什么意见能给我一下吗？，谢谢各位老师
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1楼 2026-08-09 20:27:40
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paramecium86

版主 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这类课题方法和建模同样都很重要。  首先你的结构是柔性非常大的。显然这时候必须要做构象搜索。可以见我这个帖子写的教程 https://muchong.com/t-14242735-1  ， 教程文件见网盘   通过网盘分享的文件：关于高斯入门的小小指南V1.6_paramecium86.pdf
链接: https://pan.baidu.com/s/1W6WeSIO8kUID_VKj9gIBzQ?pwd=para 提取码: para
--来自百度网盘超级会员v10的分享

这个教程里面的附录有如何做构象搜索。把结构找到之后你再根据结构来做相互作用能的计算。我目前是推荐使用CREST来做构象搜索的。上手比较快算的也相对比较快。你目前使用MM2 力场优化单一结构 过于的粗糙了。得到的结构大概率不是最低能量的构象。
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21楼2026-08-11 15:22:10
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mt13

新虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
paramecium86: 应助指数+1, 感谢回复 2026-08-11 15:15:19
不建议直接就上手建模，可以查这方面的文献，用别人计算优化出的纤维素结构，或者微调，然后再用gaussian优化
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4楼2026-08-09 20:35:58
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muchong8882楼
2026-08-09 20:28   回复  
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mt133楼
2026-08-09 20:32   回复  
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禾苗685楼
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Erric6楼
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cupbzhuwei7楼
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icm6398楼
2026-08-09 22:24   回复  
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lbw31909楼
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y1987yuyu10楼
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tfang11楼
2026-08-10 06:05   回复  
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erjianxin12楼
2026-08-10 06:25   回复  
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afengbeijing13楼
2026-08-10 06:36   回复  
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XG-WUST14楼
2026-08-10 06:37   回复  
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