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新虫 (初入文坛)

[交流] RPA联合CRISPR-Cas13a,为乙肝、丙肝快速检测开辟新路径

上一期我们提醒大众重视病毒性肝炎带来的健康威胁。乙肝(HBV)与丙肝(HCV)持续侵蚀全球无数人的健康,慢性感染逐步诱发肝硬化、肝癌。想要实现早筛早治,便捷、精准的检测手段不可或缺。近期发表于《Diagnostic Microbiology & Infectious Disease》的一项研究,搭建了基于RPA与巢式RPA的CRISPR/Cas13a诊断平台,为肝炎病毒现场快速检测提供全新解决方案。


        摆脱大型PCR仪器!新型恒温分子检测技术,助力病毒性肝炎基层筛查

        乙型肝炎与丙型肝炎是全球重要的传染性肝病。慢性乙肝、丙肝感染者大多初期没有明显症状,长期隐匿感染持续损伤肝细胞,等到身体出现不适时,往往肝脏病变已经进展至中晚期。世卫组织一直推动2030消除病毒性肝炎的公共卫生目标,而实现这一愿景的核心前提,就是扩大高危人群筛查覆盖面。

        以印度为例,丙肝病毒慢性感染者约占总人口1%,大量感染者分散在医疗资源相对薄弱的区域。在许多发展中国家和偏远地区,标准化核酸实验室数量有限,传统检测手段的短板被进一步放大。这样的现状,同样给国内基层肝炎筛查工作带来参考:想要阻断肝炎传播,我们需要能够走出中心实验室、适配基层场景的快速检测方案。

       目前临床常用肝炎检测分为两大类:血清学检测与核酸检测。血清学抗原抗体筛查操作简便、价格亲民,广泛用于常规体检,但是存在难以回避的缺陷。抗体阳性无法区分是既往感染还是现症感染,同时病毒感染窗口期无法检出,容易造成漏检

        核酸检测是肝炎诊断公认的“金标准”,直接检测病毒核酸,判断体内是否存在活跃病毒。常规核酸检测依靠实时荧光定量PCR技术,这项技术灵敏度高,但局限性十分突出。PCR扩增需要反复升降温,必须依赖昂贵的热循环仪,同时对实验室洁净环境、操作人员专业能力都有严格要求。样本转运、核酸提取、上机检测整套流程耗时漫长,很难在乡镇卫生院、流动义诊、偏远地区现场落地。

        等温扩增技术的兴起,为打破PCR设备壁垒提供了方向。RPA,即重组酶聚合酶扩增,是目前应用前景广阔的恒温核酸扩增技术。整套反应仅需维持37~42℃恒温环境,不需要复杂变温设备,依靠简易恒温模块即可完成核酸扩增,30分钟内完成靶标基因扩增。

         普通RPA技术能够实现核酸快速扩增,但单一扩增体系偶尔会出现非特异性扩增,带来假阳性风险。针对病毒载量偏低的临床样本,研究者进一步引入巢式RPA方案,通过两轮连续的等温扩增,对微量靶标核酸进行富集,有效提升检测灵敏度,解决低载量样本漏检难题。

        仅仅完成核酸扩增还不够,如何保障检测特异性?科研人员将RPA扩增体系与CRISPR-Cas13a检测体系结合,构建“扩增+特异性识别”双重保障检测平台。Cas13a蛋白(LwaCas13a)是SHERLOCK检测体系的核心元件,和大众熟知的Cas9蛋白功能不同,Cas13a偏好识别RNA靶标。

        整套工作流程清晰有序:样本中的HBV DNA、HCV RNA首先经过RPA扩增;HBV扩增产物进一步转录为RNA;向导RNA引导Cas13a精准匹配病毒靶序列。一旦识别目标核酸,Cas13a会被激活,产生旁切活性,切割体系内荧光-淬灭基团标记的报告RNA,释放荧光信号。只有扩增成功且序列精准匹配,才能产生阳性信号,双重机制大幅降低假阳性概率。

         这项发表在《Diagnostic Microbiology & Infectious Disease》的研究,使用印度临床患者队列样本开展完整验证,平台同时支持乙型肝炎病毒DNA、丙型肝炎病毒RNA同步检测。很多分子检测体系只能适配单一类型核酸,而该方案兼容DNA、RNA两类病毒,一次检测完成乙肝、丙肝联合筛查,极大提升检测效率。

         相比于传统PCR检测,这套RPA-nested RPA-CRISPR/Cas13a体系拥有多重落地优势。首先,全程恒温反应,摆脱大型仪器依赖,便携式加热装置即可满足反应条件,硬件投入门槛大幅降低;其次检测周期短,从样本处理到信号读取,短时间内出具结果,实现现场即时检测;巢式扩增方案有效提升灵敏度,针对低病毒载量样本拥有更好检出能力;同时双重识别机制保证结果可靠,适合大规模人群筛查。

          放眼国内公共卫生场景,我国慢性乙肝人群基数庞大,隐匿性丙肝感染问题同样不容忽视。很多县域医院、社区门诊不具备PCR核酸检测条件,血清学筛查阳性样本,只能送往上级医院确诊,拉长患者等待周期,不利于及时干预。这类恒温CRISPR快检技术一旦完成产业化转化,能够有效填补基层核酸检测能力缺口。

          除了常规门诊筛查,该技术还有广阔应用场景。在高危人群流动筛查、血液样本初筛、孕产妇肝炎母婴阻断筛查等场景,快速核酸检测可以快速完成样本判定,搭建“筛查-诊断-转诊”完整链条。技术框架具备通用性,后续经过体系优化,还能够拓展至其他感染性病原体检测。


          当然,新技术从实验室走向临床应用,仍然需要持续完善。一方面需要不断简化样本前处理步骤,降低操作难度,朝着“样本进、结果出”一体化试剂盒方向优化;另一方面需要积累更大规模临床样本数据,持续验证试剂盒稳定性,推动产品合规转化。同时,面向基层医务工作者的标准化操作培训,也是推广落地不可或缺的一环。


         从PCR到等温扩增,再到CRISPR分子诊断,分子检测技术持续朝着轻量化、普惠化方向发展。消除病毒性肝炎是一场持久战,技术创新就是我们手中重要的武器。大型精密设备不应该成为精准核酸检测的门槛,让高可靠的核酸检测下沉基层,及时发现隐匿感染者,尽早开展规范治疗,才能真正降低肝硬化、肝癌的发病风险。


        随着等温扩增与CRISPR诊断技术持续迭代,未来会有更多便携、低成本的快速诊断产品走进临床一线。依托RPA、巢式RPA构建的CRISPR检测平台,为肝炎防控提供了新思路,也为全球资源有限地区的传染病筛查,提供了具备可行性的技术方案。

        病毒不会区分地域,健康保障更不该受设备条件限制。持续推动分子诊断技术创新,让精准检测触达更多人群,正是生物医药技术赋能公共卫生事业的意义所在。




本文基于论文 《Development of RPA and nested-RPA based CRISPR/Cas13a diagnosticplatform for the identification of HBV DNA and HCV RNA in Indianpatient cohort》撰写,旨在技术解读,不构成临床应用建议。
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