| 查看: 1785 | 回复: 438 | ||||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 cory0931 的 82 个金币 ，回帖就立即获得 1 个金币，每人有 1 次机会 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[交流]
如何快速、批量挖掘高活性生物酶 挖酶、生物酶挖掘、挖酶教学、批量挖掘、高质量
|
||||
|
主要是提供思路，附带部分衍生阅读资料（本人已发表于其他平台） 1. 既然是快速，那自然不能是手动一个一个来，得用要专业的分析方和和技术平台； 2. 既然是要批量，那必然会涉及到如何获取高质量的靶标物质库（比如蛋白序列库、核酸序列库）； 3. 高活性，那自然少不了批量的活性预测分析； 4. 生物酶，那必然是要进行酶功能、种类的精准预测； 那么，高质量的数据从哪里来？ 1. 自有资源，包括自有菌株--已经明确其具有较高的特定功能酶活性 -- 拿到全基因组、或全蛋白组、或转录组测序数据； 2. 自由测序库，这个更容易实现——比如从油污积聚、降解油污的环境中收集样本，三代测序，拿到序列库，这其中大概率是会有对应的解油污高活性酶存在； 3. 在线库直接挖掘，这个有一定的技术门槛；其前提是获取到大量的，潜在的靶标序列，再从里面进行层层筛选、挖掘；包括但不限于 1）序列层面的筛选； 2）理化特性层面筛选； 3）结构层面的筛选； # 注意，这其中的每一步，都是批量实现的，单个操作只适用于对明确功能酶分子的精细优化、以及少量靶标的精细筛选； 怎么挖掘？ 1. 必然是要对靶标酶，有一个深刻的认识，其具体功能、理化特性、结构特征、分子动力特征等； 2. 挖掘，则是基于对靶标酶的有限认知，进行举一反三的批量发现； 其他 —— 一些别家网站的延申阅读资源； signalp6 分泌信号肽预测——全基因组级、宏基因组级分泌表达预测 Foldseek本地部署 详细教程-- cpu 模式参考 deeploc 2.1 大批量蛋白亚细胞定位分析，适合三代测序级数据、真菌全菌数据的分析 CataPro本地安装--CPU模式（cpu mode）-- 经验资料整理 CLEAN蛋白酶功能预测工具介绍 目前最精准的酶功能预测工具 全基因组蛋白分泌表达预测与优化 -- 策略-附流程图 原核生物表达异源蛋白--最佳分泌信号肽筛选策略--思路来自2018年的文献 真核生物异源蛋白高效分泌表达策略--分泌信号肽优化方案 三代测序之-- - 挖掘特定功能基因--pacbio测序数据挖掘--纳米孔测序、GenoCare等 -- 功能蛋白碗蕨 功能酶挖掘方案  |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 生物类实验技术 |
» 猜你喜欢
广西医科大学基础医学院自身免疫病课题组招收基础医学相关专业的调剂研究生
已经有2人回复
-
考研调剂：国家蛋白质科学中心（国家重点实验室）和安徽医科大学基础医学院联培
已经有4人回复
-
药理学论文润色/翻译怎么收费?
已经有168人回复
-
华南理工大学 基础医学学硕和临床医学学硕调剂
已经有11人回复
-
广西医科大学基础医学院招收基础医学、药学、生物检验相关专业的研究生
已经有1人回复
-
北京协和医学院杰青课题组招聘科研助理
已经有0人回复
-
北京协和医学院杰青课题组招聘科研助理
已经有0人回复
-
求助中国药典1995年版、二部
已经有0人回复
-
北京协和医学院杰青课题组招聘科研助理
已经有0人回复
-
求助https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2535777123 全文
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
2026年财务管理、经济与信息技术国际会议 (FMEIT 2026)
+1/516
-
合肥工业大学能源动力方向教师招聘~
+5/320
-
为所有小白祈福
+1/228
-
合肥工业大学能源动力方向教师招聘~
+1/87
-
好久没有来了，回来看看。
+1/79
-
清华大学环境课题组招聘环境工作专业客座生研究生2-3名（应用导向）
+1/14
-
祝福！基金中中中！！！！
+1/13
-
埃克塞特大学商学院管理科学/运筹/数据科学方向Dr Fanlin Meng课题组招收2027秋博士
+1/10
-
北理工集成电路杰青团队 | 诚招科助理
+1/5
-
北京理工大学-集成电路与电子学院杰青团队-招博士后
+1/4
-
中国科学院生物物理研究所田勇课题组招聘联合培养生
+1/3
-
河海大学海洋环境污染与生态毒理学研究组招收2027级硕士生 及博士研究生
+1/3
-
2026年生物学、大数据与信息工程国际会议 (BSBIE 2026)
+1/3
-
北理工集成电路杰青团队 | 诚招科助理
+1/2
-
中科院赣江创新院（稀土生物分离方向）李庭刚研究员团队招聘博士后/特别研究助理
+1/2
-
海南大学化学院—功能分子器件团队2027博士招生+博士后招聘
+1/2
-
华南理工，博士后
+1/2
-
国家级人才团队诚聘生物信息相关专业的科研助理
+1/1
-
中科院理化所热声热机团队招聘电气工程专业(电机方向)博士后/特别研究助理
+1/1
-
中山大学具身智能方向招2027届考核制博士生
+1/1
43楼2026-08-17 22:18:37
简单回复
jiaoxg3楼
2026-07-02 14:56
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
浮云1665楼
2026-07-02 14:57
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫手机客户端
toppaper8楼
2026-07-02 18:10
回复
