应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 新药研发 » 其他 » 如何快速、批量挖掘高活性生物酶 挖酶、生物酶挖掘、挖酶教学、批量挖掘、高质量
57/1返回列表
查看: 27847  |  回复: 931
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 cory0931 的 2 个金币 ，回帖就立即获得 1 个金币，每人有 1 次机会
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

cory0931

至尊木虫 (文坛精英)

[交流] 如何快速、批量挖掘高活性生物酶 挖酶、生物酶挖掘、挖酶教学、批量挖掘、高质量

主要是提供思路，附带部分衍生阅读资料（本人已发表于其他平台）
1. 既然是快速，那自然不能是手动一个一个来，得用要专业的分析方和和技术平台；
2. 既然是要批量，那必然会涉及到如何获取高质量的靶标物质库（比如蛋白序列库、核酸序列库）；
3. 高活性，那自然少不了批量的活性预测分析；
4. 生物酶，那必然是要进行酶功能、种类的精准预测；

那么，高质量的数据从哪里来？
1. 自有资源，包括自有菌株--已经明确其具有较高的特定功能酶活性 -- 拿到全基因组、或全蛋白组、或转录组测序数据；
2. 自由测序库，这个更容易实现——比如从油污积聚、降解油污的环境中收集样本，三代测序，拿到序列库，这其中大概率是会有对应的解油污高活性酶存在；
3. 在线库直接挖掘，这个有一定的技术门槛；其前提是获取到大量的，潜在的靶标序列，再从里面进行层层筛选、挖掘；包括但不限于
1）序列层面的筛选；
2）理化特性层面筛选；
3）结构层面的筛选；
# 注意，这其中的每一步，都是批量实现的，单个操作只适用于对明确功能酶分子的精细优化、以及少量靶标的精细筛选；

怎么挖掘？
1. 必然是要对靶标酶，有一个深刻的认识，其具体功能、理化特性、结构特征、分子动力特征等；
2. 挖掘，则是基于对靶标酶的有限认知，进行举一反三的批量发现；


其他  ——  一些别家网站的延申阅读资源；
signalp6 分泌信号肽预测——全基因组级、宏基因组级分泌表达预测
Foldseek本地部署 详细教程-- cpu 模式参考
deeploc 2.1 大批量蛋白亚细胞定位分析，适合三代测序级数据、真菌全菌数据的分析
CataPro本地安装--CPU模式（cpu mode）-- 经验资料整理
CLEAN蛋白酶功能预测工具介绍 目前最精准的酶功能预测工具

全基因组蛋白分泌表达预测与优化 -- 策略-附流程图
原核生物表达异源蛋白--最佳分泌信号肽筛选策略--思路来自2018年的文献
真核生物异源蛋白高效分泌表达策略--分泌信号肽优化方案
三代测序之-- - 挖掘特定功能基因--pacbio测序数据挖掘--纳米孔测序、GenoCare等 -- 功能蛋白碗蕨 功能酶挖掘方案

如何快速、批量挖掘高活性生物酶 挖酶、生物酶挖掘、挖酶教学、批量挖掘、高质量
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2026-07-02 14:21:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sznn5215

新虫 (知名作家)
支持楼主，支持原创！
赞一下 回复此楼
314楼2026-08-18 05:17:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 932 个回答
简单回复
jiaoxg3楼
2026-07-02 14:56   回复  
cory0931(金币+1): 谢谢参与
浮云1665楼
2026-07-02 14:57   回复  
cory0931(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫手机客户端
toppaper8楼
2026-07-02 18:10   回复  
cory0931(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫手机客户端
查看全部 932 个回答
提示: 如果您在30分钟内回复过其他散金贴，则可能无法领取此贴金币
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 z1aZaKkVi71s 2026-10-06 3/150 2026-10-07 16:31 by kUQbiRsIeOpF
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 z1aZaKkVi71s 2026-10-06 3/150 2026-10-07 16:09 by kUQbiRsIeOpF
[博后之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 z1aZaKkVi71s 2026-10-06 3/150 2026-10-07 15:41 by kUQbiRsIeOpF
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 z1aZaKkVi71s 2026-10-06 3/150 2026-10-07 15:41 by kUQbiRsIeOpF
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 z1aZaKkVi71s 2026-10-05 3/150 2026-10-07 15:07 by kUQbiRsIeOpF
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 z1aZaKkVi71s 2026-10-05 3/150 2026-10-07 14:49 by kUQbiRsIeOpF
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 z1aZaKkVi71s 2026-10-05 3/150 2026-10-07 14:49 by kUQbiRsIeOpF
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FlhJF7cq3uT3 2026-10-04 8/400 2026-10-07 11:11 by EXuX9l7TjjIY
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 FlhJF7cq3uT3 2026-10-04 9/450 2026-10-07 11:07 by EXuX9l7TjjIY
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 FlhJF7cq3uT3 2026-10-04 8/400 2026-10-07 11:01 by EXuX9l7TjjIY
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FlhJF7cq3uT3 2026-10-04 7/350 2026-10-07 10:51 by EXuX9l7TjjIY
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 FlhJF7cq3uT3 2026-10-04 11/550 2026-10-07 10:29 by EXuX9l7TjjIY
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 FlhJF7cq3uT3 2026-10-04 8/400 2026-10-07 10:21 by EXuX9l7TjjIY
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 FlhJF7cq3uT3 2026-10-04 9/450 2026-10-07 10:11 by EXuX9l7TjjIY
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 FUSxPqiIHRjH 2026-10-04 12/600 2026-10-07 09:49 by EXuX9l7TjjIY
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 FUSxPqiIHRjH 2026-10-04 12/600 2026-10-07 09:49 by EXuX9l7TjjIY
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 FUSxPqiIHRjH 2026-10-04 9/450 2026-10-06 14:28 by x7yLzftaCUEL
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 FUSxPqiIHRjH 2026-10-04 12/600 2026-10-06 14:26 by x7yLzftaCUEL
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 FlhJF7cq3uT3 2026-10-05 4/200 2026-10-06 05:08 by z1aZaKkVi71s
[教师之家] 烦躁 +5 水冰月月野兔 2026-10-03 5/250 2026-10-05 21:59 by 火星超人xi
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭