24小时热门版块排行榜    

查看: 1058  |  回复: 1

毕合生物2024

铜虫 (正式写手)

[交流] 不做蛋白定量,凭感觉上样=搞玄学 已有1人参与

 为什么定量不能省

同一个实验,三组不同的处理,各组细胞量完全一样,裂解液体积也一样,但细胞状态、处理效果、裂解效率不同,每管裂解物中的真实蛋白浓度可能会相差很大。

如果不做定量,直接按体积等量上样,相当于拿三个起点不同的样本去做对比。

WB的定量分析,无论是内参归一化还是总蛋白归一化,都建立在"上样总蛋白量一致"这个前提上。跳过定量直接上样,后期数据分析时就算有差异,也无法确认是实验造成的差异,说不定本来没差异,你上样量不同才造成差异的。

而且,实验数据不是只做出一次就OK了,还需要实验重复,有的同学重复数据做来做去都不好,也需要考虑一下是不是没做定量的原因。

蛋白定量用什么方法

目前最常用的两种蛋白定量方法是BCA法和Bradford法,各有各的适用场景。

BCA法

BCA(二喹啉甲酸)法的原理是:在碱性条件下,蛋白质将Cu²⁺还原为Cu⁺,BCA 试剂与Cu⁺结合形成紫色复合物,在562nm处有强吸收。颜色深浅与蛋白浓度成正比。

这种方法目前在实验室使用的是比较多的。但如果你提蛋白时,用的裂解液或试剂盒或提取方法需要加入DTT 、β-巯基乙醇来辅助提取的话,就可能不适合用BCA,因为这些还原剂会被当成蛋白,将Cu²⁺还原为Cu⁺,最后显色时让读数偏高。

Bradford法

Bradford法的原理是:考马斯亮蓝G-250在酸性条件下与蛋白质结合,染料的最大吸收峰从465nm移至595nm,通过测定595nm的吸光度来计算蛋白浓度。

如果目标蛋白(如脂蛋白、某些坚韧性蛋白)富含甘氨酸、丙氨酸、脯氨酸而几乎不含碱性/芳香残基,则蛋白与考马斯亮蓝G-250染料的结合效率远低于BSA,导致严重低估实际量。

BCA和Bradford两种方法本身没有绝对的好坏,关键是适配自己的样品体系。选择一种方法后,尽量在整批实验中使用同一种方法,避免交叉带来额外误差。

4 上样量怎么定

蛋白定量完成后,等量上样的计算结果很简单:用测得的蛋白浓度算出每孔需要吸取的体积。

例如:测得某样本蛋白浓度为2μg/μL,计划每孔上样10μg,则每孔需要5μL蛋白液。如果每孔上样体积为10μL,就可以按照5μL的蛋白液+3μL的RIPA+2μL的5× Loading Buffer混合(使 Loading Buffer 总浓度为 1×),煮沸变性后上样。

关于上样量的参考值,这里有一份简单的范围建议:

常规细胞裂解物,每孔20μg总蛋白通常足够

蛋白丰度较低的目标,可适当提高到40-60μg

组织样本通常需要更多,40-80μg是常见范围

如果目标蛋白丰度很高,可以先从10μg开始尝试

初次做某个蛋白的WB时,建议做一个上样量梯度测试。从10μg到60μg设置几个梯度的上样量,观察目标蛋白的信号强度和线性关系,找到最适合的上样量。

 其他注意事项

稀释标准品或样品

如果样品是RIPA裂解的,标准品和样品也应该用同样的RIPA来稀释——不同的缓冲液体系会影响显色反应。

上样体积一致

不同泳道的上样体积相差过大会影响电泳效果。如果各样本浓度差异较大,可用裂解液将各组样品稀释至相近浓度,使上样体积尽量一致(通常控制在10-20μL/孔)。

点样孔不要留空

上样布局中,如果有空余的泳道,需要用1×Loading Buffer补齐至与样本孔相同的体积,防止边缘效应导致的条带变形。

上样量一致了,但内参条带还是不齐

在排除定量、个人操作方面、样本来源一致等问题后,这个现象说明蛋白可能降解了。

毕合生物提供服务内容:分子生物学、免疫, 重组蛋白及ELISA相关、活性小分子化合物、高端化学、材料化学、细胞资源库与培养相关、生命科学、天然产物
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

过烟云烟

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
老师您好,有一个问题请教一下。
做动物实验的WB,每组有老鼠8只,算上对照有4个组,共32只,那么我在做WB的时候,需要把32个样本都做吗?
不要因为别人交卷了,就乱选答案
2楼2026-08-27 12:09:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 毕合生物2024 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+3 Tsingking1 2026-08-27 14/700 2026-09-01 08:29 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 5/250 2026-08-31 14:40 by hahaboy
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见