24小时热门版块排行榜    

查看: 1051  |  回复: 1

毕合生物2024

铜虫 (正式写手)

[交流] 不做蛋白定量,凭感觉上样=搞玄学 已有1人参与

 为什么定量不能省

同一个实验,三组不同的处理,各组细胞量完全一样,裂解液体积也一样,但细胞状态、处理效果、裂解效率不同,每管裂解物中的真实蛋白浓度可能会相差很大。

如果不做定量,直接按体积等量上样,相当于拿三个起点不同的样本去做对比。

WB的定量分析,无论是内参归一化还是总蛋白归一化,都建立在"上样总蛋白量一致"这个前提上。跳过定量直接上样,后期数据分析时就算有差异,也无法确认是实验造成的差异,说不定本来没差异,你上样量不同才造成差异的。

而且,实验数据不是只做出一次就OK了,还需要实验重复,有的同学重复数据做来做去都不好,也需要考虑一下是不是没做定量的原因。

蛋白定量用什么方法

目前最常用的两种蛋白定量方法是BCA法和Bradford法,各有各的适用场景。

BCA法

BCA(二喹啉甲酸)法的原理是:在碱性条件下,蛋白质将Cu²⁺还原为Cu⁺,BCA 试剂与Cu⁺结合形成紫色复合物,在562nm处有强吸收。颜色深浅与蛋白浓度成正比。

这种方法目前在实验室使用的是比较多的。但如果你提蛋白时,用的裂解液或试剂盒或提取方法需要加入DTT 、β-巯基乙醇来辅助提取的话,就可能不适合用BCA,因为这些还原剂会被当成蛋白,将Cu²⁺还原为Cu⁺,最后显色时让读数偏高。

Bradford法

Bradford法的原理是:考马斯亮蓝G-250在酸性条件下与蛋白质结合,染料的最大吸收峰从465nm移至595nm,通过测定595nm的吸光度来计算蛋白浓度。

如果目标蛋白(如脂蛋白、某些坚韧性蛋白)富含甘氨酸、丙氨酸、脯氨酸而几乎不含碱性/芳香残基,则蛋白与考马斯亮蓝G-250染料的结合效率远低于BSA,导致严重低估实际量。

BCA和Bradford两种方法本身没有绝对的好坏,关键是适配自己的样品体系。选择一种方法后,尽量在整批实验中使用同一种方法,避免交叉带来额外误差。

4 上样量怎么定

蛋白定量完成后,等量上样的计算结果很简单:用测得的蛋白浓度算出每孔需要吸取的体积。

例如:测得某样本蛋白浓度为2μg/μL,计划每孔上样10μg,则每孔需要5μL蛋白液。如果每孔上样体积为10μL,就可以按照5μL的蛋白液+3μL的RIPA+2μL的5× Loading Buffer混合(使 Loading Buffer 总浓度为 1×),煮沸变性后上样。

关于上样量的参考值,这里有一份简单的范围建议:

常规细胞裂解物,每孔20μg总蛋白通常足够

蛋白丰度较低的目标,可适当提高到40-60μg

组织样本通常需要更多,40-80μg是常见范围

如果目标蛋白丰度很高,可以先从10μg开始尝试

初次做某个蛋白的WB时,建议做一个上样量梯度测试。从10μg到60μg设置几个梯度的上样量,观察目标蛋白的信号强度和线性关系,找到最适合的上样量。

 其他注意事项

稀释标准品或样品

如果样品是RIPA裂解的,标准品和样品也应该用同样的RIPA来稀释——不同的缓冲液体系会影响显色反应。

上样体积一致

不同泳道的上样体积相差过大会影响电泳效果。如果各样本浓度差异较大,可用裂解液将各组样品稀释至相近浓度,使上样体积尽量一致(通常控制在10-20μL/孔)。

点样孔不要留空

上样布局中,如果有空余的泳道,需要用1×Loading Buffer补齐至与样本孔相同的体积,防止边缘效应导致的条带变形。

上样量一致了,但内参条带还是不齐

在排除定量、个人操作方面、样本来源一致等问题后,这个现象说明蛋白可能降解了。

毕合生物提供服务内容:分子生物学、免疫, 重组蛋白及ELISA相关、活性小分子化合物、高端化学、材料化学、细胞资源库与培养相关、生命科学、天然产物
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

过烟云烟

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
老师您好,有一个问题请教一下。
做动物实验的WB,每组有老鼠8只,算上对照有4个组,共32只,那么我在做WB的时候,需要把32个样本都做吗?
不要因为别人交卷了,就乱选答案
2楼2026-08-27 12:09:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 毕合生物2024 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 5/250 2026-09-01 05:45 by o3EMxHUAQDtS
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 5/250 2026-09-01 05:43 by o3EMxHUAQDtS
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见