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各虫友，大家好。我在用swiss-model进行蛋白质三级结构预测，蛋白质的结构图出来了，但是不知道这个结构的具体信息，如蛋白质的结构域，每个结构域所包含的部分是什么，等。 请各位高手指点！！！谢谢了！！！！ |
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xiaozi2964
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2楼2009-11-18 19:54:35
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3楼2009-11-18 20:37:05
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
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利用ExPaSy服务器（http://expasy.org/）的Prosite工具分析蛋白质的结构位点。Prosite是一个关于蛋白家族的结构域的数据库,将序列与数据库进行比较可以找到一些蛋白质上的特殊结构,为新蛋白序列的归类提供线索。 利用HomoloGene寻找一个基因编码蛋白的保守结构域及所归属的超家族。 我以前做过，做的不好，也是新手！仅供交流！！  |
4楼2009-11-19 09:29:33
xiaozi2964
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还有，利用Scansite分析motif（http://scansite.mit.edu/），采用默认参数，选择high Stringency，寻找蛋白质序列中易于被特定的蛋白酶磷酸化的模体和绑定结构域。 现在都忘得差不多了，大家互相学习！！  |
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