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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】微机集群组建征求大家意见
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yaogejlu

至尊木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】微机集群组建征求大家意见

大家好，我准备组建台式机的集群，用来进行CASTEP、VASP、Wien2k的计算。每台电脑打算配制如下：

CPU     Intel   酷睿2四核Q9550（盒）2.83GHz
硬盘    希捷    500G 7200.12 (ST3500418AS）
内存    宇瞻    2G  DDR2 800 *4 ＝ 8G
主板(集成显卡)  Intel  原厂 DG45ID
机箱    酷冷至尊毁灭者+后置风扇
电源    航嘉    磐石500二代 400W

共计12台。
我不知道建好的集群效率会如何:一方面可以将12台微机连成一个集群，用1个千兆交换机（24口）。
                              另一方面可以每4台电脑组成一个集群，分3组，用3个千兆交换机（8口）。
                              还有6台一组，分2组，用2个千兆交换机（8口）。
我不知道那一种组法合理,因为我怕买错了交换机浪费银子。

千兆交换机从几百元到几千元不等，各位虫友能否针对我的情况帮推荐几款性价比高的千兆交换机，或者是一些必要的参数、标准，以便有个选择。

另外，网线用超五类线还是六类线，据说六类线是不能自己做的。我认为六类线用RJ-45接头效果应该比超五类线好，带宽更大。

以上的12台电脑是否换为6台双CPU（每个4核）共8核的6台电脑组集群更合适,因为价钱相差不会太多。

[ Last edited by wuli8 on 2009-11-28 at 09:38 ]
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1楼 2009-11-16 23:03:54
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js.ao

银虫 (正式写手)
★
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 11-17 10:15
机器买好了，只等自己搭建了是吧？
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爱是一道光，如此美妙
2楼2009-11-17 08:39:52
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cationly

木虫 (正式写手)
★ ★
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 11-17 10:15
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 11-17 20:07
为什么不用XEON呢？
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3楼2009-11-17 09:35:17
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yaogejlu

至尊木虫 (小有名气)
★
dongdong3881(金币+1,VIP+0):多谢回帖 11-17 17:40
谢谢一楼的js.ao，目前先买了四台，这四台在以单机形式运算。打算这个月或下个月把剩下的8台买了。也正是由于与二楼的cationly的想法一致，所以现在有些犹豫（感谢二楼），如果要买制强的话，就得买双CPU（每个4核）8核的了。
实际上我不清楚交换机与节点机的最佳搭配方案：
一方面是不清楚每个节点机采用单CPU4核，还是采用双CPU8核，
另一方面是不清楚究竟是几台节点机与什么样的千兆交换机搭配。
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4楼2009-11-17 10:15:13
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cationly

木虫 (正式写手)
★
dongdong3881(金币+1,VIP+0):多谢 11-17 17:41
引用回帖:
Originally posted by yaogejlu at 2009-11-17 10:15:
谢谢一楼的js.ao，目前先买了四台，这四台在以单机形式运算。打算这个月或下个月把剩下的8台买了。也正是由于与二楼的cationly的想法一致，所以现在有些犹豫（感谢二楼），如果要买制强的话，就得买双CPU（每个4核 ...

瓶颈应该不在网络，如果是用NFS，硬盘的速度比较重要了，见过40个节点用一个千兆交换机的
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5楼2009-11-17 10:50:28
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cationly

木虫 (正式写手)
★
dongdong3881(金币+1,VIP+0):感谢回帖 11-17 17:41
现在55系列的XEON+DDR3不知道具体能快多少，希望有人能测试一下
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6楼2009-11-17 10:53:03
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★
dongdong3881(金币+1,VIP+0):多谢、 11-17 17:41
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 11-17 22:35
节点内速度绝对高于节点之间的运算效果。

XEON ＋ ECC 内存， 14000rpm SCSI磁盘，应该比你用的要快！

如果有过硬的维护技术，自己组建也是比较有意思的...
否则，真不知是作计算呢，还是维护机器呢....
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
7楼2009-11-17 11:23:31
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nwpu_1223

金虫 (小有名气)
★ ★
dongdong3881(金币+1,VIP+0):多谢交流 11-17 17:41
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 11-17 22:36
引用回帖:
Originally posted by yaogejlu at 2009-11-16 23:03:
大家好，我准备组建台式机的集群，用来进行CASTEP、VASP、Wien2k的计算。每台电脑打算配制如下：

CPU     Intel   酷睿2四核Q9550（盒）2.83GHz
硬盘    希捷    500G 7200.12 (ST3500418AS）
内存    宇瞻  ...

电源好像低了，至少弄个450的，还有就是如果你现在还没有买的话，建议你先不要买，可以可以考虑买I7-920这个可以支持DDR3通道，我这里有一点资料，i7-920 2.66 GHz DDR3-800/1066 24 GB  284  华硕P6T 2500 价钱和9550差不多。
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我的计算我做主
8楼2009-11-17 11:45:10
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nwpu_1223

金虫 (小有名气)
★
dongdong3881(金币+1,VIP+0):多谢交流 11-17 17:42
引用回帖:
Originally posted by cationly at 2009-11-17 10:53:
现在55系列的XEON+DDR3不知道具体能快多少，希望有人能测试一下

三通道和两通道都存在的一个技术问题就是，三通道支持6根，2通道支持4根，如果多了比如你上12 或者 8根的话，内存的频率就会降低，所以最大的优化就是走一组，而不是两组，三通道内存的理论性能也能比同频率双通道内存提升50%以上。

我们后来测试了一下，要快30%左右。
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我的计算我做主
9楼2009-11-17 11:47:43
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js.ao

银虫 (正式写手)
★
dongdong3881(金币+1,VIP+0):多谢交流 11-17 17:42
减少节点数比较好，推荐使用双路四核。
把已经买的一台作为一个管理节点。
其他的三台做个小集群，用于学生做计算。
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爱是一道光，如此美妙
10楼2009-11-17 16:19:32
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