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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】微机集群组建征求大家意见
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nwpu_1223

金虫 (小有名气)
★
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 11-17 20:07
引用回帖:
Originally posted by js.ao at 2009-11-17 16:19:
减少节点数比较好，推荐使用双路四核。
把已经买的一台作为一个管理节点。
其他的三台做个小集群，用于学生做计算。

这个建议不错，以前我们就是这么干的，呵呵
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我的计算我做主
11楼2009-11-17 19:37:31
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yaogejlu

至尊木虫 (小有名气)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 11-19 17:59
引用回帖:
cationly：瓶颈应该不在网络，如果是用NFS，硬盘的速度比较重要了，见过40个节点用一个千兆交换机的

引用回帖:
abbott：  XEON ＋ ECC 内存， 14000rpm SCSI磁盘，应该比你用的要快！

引用回帖:
js.ao： 减少节点数比较好，推荐使用双路四核。

谢谢 js.ao、cationly、abbott、nwpu_1223的热情帮助，综合以上虫友的意见，我认为速度的瓶颈不在网络。
CPU 主板 内存 硬盘四个配件中，前三个只要是同类的产品，服务器和台式机在数据带宽上应该是一致的，速度不应该有差别，我认为瓶颈在硬盘上，SCSI的硬盘会比普通的SATA硬盘快很多，提升硬盘性能是组建小型集群的关键。
一种方法是可以采用在普通的台式机内使用SCSI硬盘，我猜测在主节点上使用即可。
另一种是用js.ao的方法：减少节点数，推荐使用双路四核。
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12楼2009-11-18 20:38:20
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yaogejlu

至尊木虫 (小有名气)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):thank you very much! 11-19 17:59
补充一下：
一种方法是可以采用在普通的台式机内使用SCSI硬盘，我猜测在主节点上使用即可，需借助PCI-SCSI转接卡，或者借助两块SATA组建阵列RAID
另一种是用js.ao的方法：减少节点数，推荐使用双路四核。使用普通SATA硬盘或SCSI硬盘。
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13楼2009-11-18 20:47:47
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tjyl

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
mingdong(金币+3,VIP+0):感谢交流! 11-19 11:03
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 11-19 11:54
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 1-10 20:19
SCSI硬盘并不能快多少，不要忘记其存储密度其实原不如现在单碟500G的硬盘大。
要想磁盘速度更快只有组RAID。

实际上前兆网往往是并行时最大的瓶颈，要不然很多人就不会花大价钱上IB了。
硬件上决定并行效率的同时有带宽和延迟。
引用回帖:
Originally posted by yaogejlu at 2009-11-18 20:38:





谢谢 js.ao、cationly、abbott、nwpu_1223的热情帮助，综合以上虫友的意见，我认为速度的瓶颈不在网络。
CPU 主板 内存 硬盘四个配件中，前三个只要是同类的产品，服务器和台式机在数据带宽上应该是一 ...

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14楼2009-11-18 21:41:12
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nwpu_1223

金虫 (小有名气)
★ ★
fegg7502(金币+1,VIP+0):thank you very much! 11-19 17:59
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 11-19 19:38
引用回帖:
Originally posted by tjyl at 2009-11-18 21:41:
SCSI硬盘并不能快多少，不要忘记其存储密度其实原不如现在单碟500G的硬盘大。
要想磁盘速度更快只有组RAID。

实际上前兆网往往是并行时最大的瓶颈，要不然很多人就不会花大价钱上IB了。
硬件上决定并行效率的 ...

SCSI的硬盘好像现在大家都不用了，现在是SAS硬盘，如果想做好备份，那肯定是要磁盘阵列了，推荐3块盘做成RAID5 或者四块盘做成RAID10，但是还有一个问题就是看经费了，性能上去了，当然价格也就上去了。
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我的计算我做主
15楼2009-11-19 12:49:11
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nwpu_1223

金虫 (小有名气)
楼主听这个多虫子的建议，不知道，现在机器弄好了没有，弄好也和大家分享一下，你的经验啊
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我的计算我做主
16楼2009-11-20 19:44:41
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wally8962

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 11-21 09:46
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 11-21 09:48
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 1-10 20:17
前不久测试了一下vasp。证实一点，vasp对于内存带宽的要求极高。因此采用intel nehalm核心的cpu应该是当前最佳选择。
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17楼2009-11-20 22:28:18
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yaogejlu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by nwpu_1223 at 2009-11-20 19:44:
楼主听这个多虫子的建议，不知道，现在机器弄好了没有，弄好也和大家分享一下，你的经验啊

谢谢大家对我的支持和帮助，我是这么打算的：
按照我的4万元的预算，我打算执行一开始我的台式机的预算选酷睿构架的Q9550(盒)。从我的预算角度出发i7以及i7构架制强的价格我承受不了。虽勉强能承受酷睿构架的制强（8核2.33GHz），但也只是四台，并不多。我选这个时间买Q9550也是由于此时的价格便宜，并且Q9550也快退市了，想借此机会买得实惠一点。网上有i5与Q9550的对比测试，i5只领先1～5％。我打算以后i7便宜了再买i7。

经过大家的讨论，我是这么想的：瓶颈在带宽、延迟和硬盘。所以我的12台Q9550要么组合，要么分两组，用好一点的交换机（1或2台），配超五类或6类线（是交换机而定），必要时再买双核的1～2台当主节点。这样组成的集群如果还不理想的话，就在主节点上用SATA的磁盘阵列。（500G ST3500418AS的硬盘也很便宜，个人感觉速度也满快的）。

谢谢大家的支持，做研究是需要钱的，要是经费充的话就不会天天考虑这些问题了，现在只是用DIY当钱用。
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18楼2009-11-21 10:16:40
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wally8962

木虫 (著名写手)
★ ★
yaogejlu(金币+1,VIP+0): 11-22 19:16
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 11-22 22:35
老兄，你最好买之前想法实测一下。这才是最省钱的法子。
“网上有i5与Q9550的对比测试，i5只领先1～5％。”，测得什么东西？网上很难看到专业方面的评测。如果测的是什么winbench、superpi之类的，恐怕没什么参考价值。
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19楼2009-11-21 16:12:31
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yaogejlu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wally8962 at 2009-11-21 16:12:
老兄，你最好买之前想法实测一下。这才是最省钱的法子。
“网上有i5与Q9550的对比测试，i5只领先1～5％。”，测得什么东西？网上很难看到专业方面的评测。如果测的是什么winbench、superpi之类的，恐怕没什么参考 ...

谢谢提醒，大家如果有相关的计算效率的测试请粘贴上分享一下。
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20楼2009-11-22 19:19:12
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