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新虫 (小有名气)

[交流] 寡核苷酸合成的粗品纯度,多少算合格?

最近送了几条寡核苷酸合成的样品去做质谱,粗品纯度都在70%-80%之间,有的更低。供应商说这个纯度正常,但总觉得不太放心。

查了下资料,纯度跟链长、修饰类型、合成规模都有关系。短链引物能到85%以上,长链或者带特殊修饰的,60%多也常见。但我们实验室自己合成时,纯度老是上不去,不知道是偶联效率问题还是纯化环节没控制好。

想问问经常做寡核苷酸合成的同行,你们粗品纯度一般能到多少?哪种情况该怀疑是合成仪的问题,哪种情况是试剂或者操作的问题?

还有,粗品纯度过低的时候,你们是重新合成,还是多过一遍纯化柱硬救回来?后者总觉得损失太大,但重新合成又费时间。
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