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adolff

金虫 (初入文坛)

[交流] 请教在cif文件中添加H键表的问题(关于对称码)

最近做了个晶体,它的堆积图显示存在O-H...N的分子间H键,我用论坛上教的方法(在ins文件加HTAB,精修),在lst文件中发现如下结果:
Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and   110 deg.

D-H              d(D-H)   d(H..A)   
O-H0A          0.944    2.045   150.88    2.906    N [ -x+1, -y, -z+1 ]

但我想在cif文件中添加H键表时,不知该H键对应的对称码是多少,到底哪个四位数是对应[ -x+1, -y, -z+1 ]的,什么地方有这种数字和坐标对应关系的讲解的?请各位高手给予指教,谢谢!(另:我用platon计算H键,倒是给出了个数字,但填入cif文件后,发现并不是对应[ -x+1, -y, -z+1 ]的。我看有帖子说有时platon的结果和SHELXTL会不相同,应以SHELXTL的为准。那到底该怎么做呢?)

[ Last edited by adolff on 2009-11-16 at 15:12 ]
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 11-18 09:50
在.ins中加

eqiv $1   -x+1, -y, -z+1
htab O N_$1

然后再精修到收敛, 就不会有问题了, 在CIF中回直接看到.
见我的贴子.
xi2004-emuch@163.com
2楼2009-11-16 15:27:08
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秦涞

木虫 (正式写手)

四叶草


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-11-16 15:27:
在.ins中加

eqiv $1   -x+1, -y, -z+1
htab O N_$1

然后再精修到收敛, 就不会有问题了, 在CIF中回直接看到.
见我的贴子.

真强我什么时候才能学得这么好啊
珍惜每一天的幸福,我们会幸福一辈子!
3楼2009-11-16 20:35:01
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adolff

金虫 (初入文坛)

问题解决,真是太谢谢了
那再请问xi2004大哥,这两个命令中$1代表什么啊?
4楼2009-11-16 21:54:00
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 11-18 09:50
一美元啊!

建议楼主看看shelx 说明书

$1表示对称操作No.1
xi2004-emuch@163.com
5楼2009-11-16 22:11:41
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