24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
查看: 890  |  回复: 10
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】处理500个原子的分子

用MOPAC里面的PM6先优化一下,再拿到GAUSSIAN里面用DFT单点计算,看看电子密度,有没有看到什么文献里面采用过半经验优化+DFT单点计算的模式?好拿来做参考.

[ Last edited by tiechong on 2009-11-16 at 12:11 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉


yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-18 10:58
引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2009-11-16 09:06:
用MOPAC里面的PM6先优化一下,再拿到GAUSSIAN里面用DFT单点计算,看看电子密度,有没有看到什么文献里面采用过半经验优化+DFT单点计算的模式?好拿来做参考.

[ Last edited by tiechong on 2009-11-16 at 12:11 [ ...

500个原子的话,DFT单点最好用密度拟合的方法来做,这样才能算出来,注意内存一定要大,并且据我的经验,基组不必选的太大,这么大的体系,DFT的泛函可能不太适合,用大机组没有用,小机组反倒可能有“误差抵消”效应
技术博客:http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
11楼2009-11-18 10:46:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

gongxd325

至尊木虫 (文坛精英)


tiechong(金币+1,VIP+0): 11-16 09:58
tiechong(金币+1): 2010-02-06 09:24
没见过,假如结构有对称性,采用对称性试试
一个人做点好事并不难难的是一辈子做好事!!!
2楼2009-11-16 09:20:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


tiechong(金币+1,VIP+0): 11-16 09:58
tiechong(金币+1): 2010-02-06 09:24
这样就只能依赖对称性了
3楼2009-11-16 09:27:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiechong

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-11-16 09:27:
这样就只能依赖对称性了

对称性也不是很好,
而且本来有980个原子,调整成Ci 对成性,现在还有490个原子,

[ Last edited by tiechong on 2009-11-16 at 09:58 ]
4楼2009-11-16 09:54:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见