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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】处理500个原子的分子

用MOPAC里面的PM6先优化一下,再拿到GAUSSIAN里面用DFT单点计算,看看电子密度,有没有看到什么文献里面采用过半经验优化+DFT单点计算的模式?好拿来做参考.

[ Last edited by tiechong on 2009-11-16 at 12:11 ]
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1楼 2009-11-16 09:06:37
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gongxd325

至尊木虫 (文坛精英)
★
tiechong(金币+1,VIP+0): 11-16 09:58
tiechong(金币+1): 2010-02-06 09:24
没见过，假如结构有对称性，采用对称性试试
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一个人做点好事并不难难的是一辈子做好事!!!
2楼2009-11-16 09:20:25
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
tiechong(金币+1,VIP+0): 11-16 09:58
tiechong(金币+1): 2010-02-06 09:24
这样就只能依赖对称性了
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3楼2009-11-16 09:27:34
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tiechong

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-11-16 09:27:
这样就只能依赖对称性了

对称性也不是很好，
而且本来有980个原子，调整成Ci 对成性，现在还有490个原子,

[ Last edited by tiechong on 2009-11-16 at 09:58 ]
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4楼2009-11-16 09:54:30
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liujun2006

金虫 (小有名气)
★
tiechong(金币+1,VIP+0): 11-18 00:49
看看能不能冻结一部分原子，DFT作单点计算量也是很大的。
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5楼2009-11-16 10:05:20
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
★ ★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-17 18:43
tiechong(金币+1,VIP+0): 11-18 00:49
个人认为一味地加大计算体系是没有太大意义的，因为一个大的体系中，就你考虑的问题而言，一定有主要矛盾与次要矛盾之分，为什么不考虑下哪个更主要些进而简化模型呢？
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愿好运与快乐伴随你！
6楼2009-11-16 10:49:32
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-16 12:56
tiechong(金币+1,VIP+0): 11-18 00:49
既然是分子模拟嘛，模拟就不一定非要原型不可啊。难道你的体系就不能简化么？
你放心，只要你简化解释的合理，远比你现在的方案可信一些，发文章也不会有谁非要刁难你的。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
7楼2009-11-16 11:59:12
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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉
★ ★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-17 10:10
tiechong(金币+1,VIP+0): 11-18 00:49
引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2009-11-16 09:54:



对称性也不是很好，
而且本来有980个原子，调整成Ci 对成性，现在还有490个原子,

[ Last edited by tiechong on 2009-11-16 at 09:58 ]

490个原子的体系就是STO-3G似乎也撑不住，还是按大家说的，简化模型吧，我觉得你完全用半经验方法算得出的结果更有用
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技术博客：http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
8楼2009-11-16 18:00:55
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wh-32290

铁虫 (小有名气)

分层处理

★ ★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-17 10:10
tiechong(金币+1,VIP+0): 11-18 00:49
对于核心结构部分进行高水平计算，对非核心应用半经验方法计算
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9楼2009-11-16 18:48:52
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匿名

用户注销 (著名写手)
★ ★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):对分层处理得到的结果有不放心的感觉，这句话我特同意 11-17 18:43
tiechong(金币+1,VIP+0):确实不放心分层处理 11-18 00:49
本帖仅楼主可见
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10楼2009-11-17 17:33:44
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