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bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 最近看一篇3D-QSAR文章,他把手性分子删除了!!

最近看一篇QSAR文章,他把手性分子删除了!! 是不是因为在sybyl里面手性的两个分子它识别不出来,所以删除,有没有更好的方法,让sybyl识别出手性。不删除这些。 两个手性分子的活性相差很大。 如果识别不出来就那就得删除!



谢谢!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 20:36 ]
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arthurii

木虫 (正式写手)

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zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流! 11-17 14:57
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-18 11:28
什么样的手性分子?是不是测活性的数据没有测对应的手性类型然后结构对不上活性所以删除掉了?
2楼2009-11-16 16:56:36
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zuoyinglin

铁杆木虫 (正式写手)

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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 11-18 11:28
是不是测活性时,两个分子没分开,是一个混合物。只有单一的纯化合物,才能用于建模。绝对不是sybyl识别不出手性。
分享=快乐 交流=进步
3楼2009-11-16 23:18:00
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bbslover

金虫 (正式写手)

★ ★
zeoliters(金币+2,VIP+0):多谢回帖交流! 11-17 14:57
Only achiral inhibitors or those
of known absolute chiral configurations were employed. The in
vitro bioactivities of most collected inhibitors are expressed as
the  concentration  of  the  test  compound  that  inhibited  NA
activity by 50% (IC50)  原文是这么说的。
4楼2009-11-17 01:37:49
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lj623

金虫 (小有名气)

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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-18 11:28
在sybyl中,手性中心会修改错
5楼2009-11-17 16:08:45
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arthurii

木虫 (正式写手)

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zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流! 11-18 14:02
引用回帖:
Originally posted by bbslover at 2009-11-17 01:37:
Only achiral inhibitors or those
of known absolute chiral configurations were employed. The in
vitro bioactivities of most collected inhibitors are expressed as
the  concentration  of  the ...

在下英文不是太好,不过上面应该就是这个意思,只有非手性和确定手性情况的化合物才使用。有些分子有活性,但是手性部位没标明,这样输入之后也不知道该用哪种手性情况,这些排除掉,很合理。
6楼2009-11-18 10:40:32
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