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louiyang

木虫 (正式写手)


[交流] cif几个A类错误怎么改

Alert level A
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       8.86 Ratio
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       7.90 Ratio
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C57     
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O11     
PLAT360_ALERT_2_A Short  C(sp3)-C(sp3) Bond  C56    -   C58    ...       1.17 Ang.
PLAT058_ALERT_1_A Maximum Transmission Factor Missing ............          ?
PLAT059_ALERT_1_A Minimum Transmission Factor Missing ............          ?
--------------------------------------------------------------------------------
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pop-popy

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 11-16 10:29
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       8.86 Ratio
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       7.90 Ratio
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C57  
上面三条与数据质量有关,没法改。
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O11 氧上氢要加上。
PLAT360_ALERT_2_A Short  C(sp3)-C(sp3) Bond  C56    -   C58    ...       1.17 Ang. 用dfix命令将两C原子距离拉长点。
PLAT058_ALERT_1_A Maximum Transmission Factor Missing ............          ?
PLAT059_ALERT_1_A Minimum Transmission Factor Missing ............          ?
这两条可以check后的结果有提示,也可以用xprep计算得到,计算时需要hkl和raw文件。
退思补过
2楼2009-11-15 19:46:24
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louiyang

木虫 (正式写手)


dfix 不管用呢
3楼2009-11-15 20:06:41
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pop-popy

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
应该管用,距离设长点啊
退思补过
4楼2009-11-15 21:35:23
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

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eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢 参与 11-16 10:29
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       8.86 Ratio
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       7.90 Ratio
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C57  
上面三条与数据质量有关,没法改。

个别C的Ueq异常, 比如C57, 看看是不是过大, 考虑无序处理(裂分)

PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O11 氧上氢要加上。
PLAT360_ALERT_2_A Short  C(sp3)-C(sp3) Bond  C56    -   C58    ...       1.17 Ang. 用dfix命令将两C原子距离拉长点。

先DFIX 1.54 0.001 C56 C58
修几轮后再改为dfix 1.54 0.01

PLAT058_ALERT_1_A Maximum Transmission Factor Missing ............          ?
PLAT059_ALERT_1_A Minimum Transmission Factor Missing ............          ?
这两条可以check后的结果有提示,也可以用xprep计算得到,计算时需要hkl和raw文件。


这个要查看数据还原后的原始文件, 比如crystalclear.cif, sab.abs等
xi2004-emuch@163.com
5楼2009-11-15 22:38:40
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louiyang

木虫 (正式写手)


谢谢xi2004老师,疑难问题处理高手
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-11-15 22:38:
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       8.86 Ratio
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       7.90 Ratio
PLAT241_ALERT_2_A Check Hig ...

6楼2009-11-16 09:36:42
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