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yaohua009

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】如何对配基进行能量最小化操作

用DS2.1对小分子和大分子进行对接时,我是用Chemdraw 画小分子,然后用chem3D转化为3D,再用chem3D作能量优化,但不尽人意,想用别的软件对其进行能量最小化,不知用何软件,如何操作?
最好比较好上手的软件最佳.先谢了.

[ Last edited by yaohua009 on 2009-11-14 at 20:47 ]
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yaohua009

木虫 (著名写手)

多谢楼上2位的帮助,看来还要学"gaussian"
4楼2009-11-15 14:34:39
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yanmingsun18

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
用gaussian和gaussview试试
2楼2009-11-14 21:35:59
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 11-15 17:08
可以用GV对接啊 如果gaussian与GV安装在一起,对接完后,还可在GV上实现图形界面操作,用低精度的方法和基组先初始优化一下,再用高精度的方法优化。
你也可以尝试在molden中建模,特别对于高对称性的分子
3楼2009-11-14 21:44:12
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