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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

[交流] 【beefly个人文集】总结:Gaussian结果无法用其它程序重复的原因已有1人参与

周期体系的量子化学计算结果,通常无法用其他程序重复,因为倒空间积分、库仑势等的算法存在差别。但是对于孤立体系的计算(原子、分子、团簇),不同的程序中的同样方法原则上应该得到相同的结果(在计算精度内),当然前提是分子结构相同。但也有一些例外。对于Gaussian而言,可能的原因有:

1. 使用的基组不同。即使是同名基组,因发表年代不同也会略有差别,因此要把基组打印出来,仔细检查基组是否完全相同。

2. 直角基函数和球谐基函数。不同程序的默认设置不同,结果也是不一样的。Gaussian中的默认设置随基组类型而定(见基组说明部分),或者在输入中直接定义。

3. 对于DFT计算,需要考虑积分格点的差别。不过在一般情况下,对总能量的影响不会非常大。

4. 对于杂化泛函,还有个更重要的原因:相名不同义。
最著名的是B3LYP:在局域关联部分,Gaussian用VWN-3而不是原始文献建议的VWN-5,幸好大多数密度泛函程序同时提供两个版本的B3LYP。
最近发现的是O3LYP,在文献中,OPTX项的因子定义不明确导致混乱:在Gaussian中采用的因子是0.8133*1.43169(据称计算结果和O3LYP原始文献一致;但也有反例,见PCCP,2004,6,673),而PC-GAMESS和ORCA程序采用0.8133(最新版本的PC-GAMESS也支持前一种定义)。此外,Jaguar和PQS程序的O3LYP结果都不同于以上两者,技术细节不清楚。

5. Post-HF计算也存在相名不同义的问题。如Gaussian的MR-MP2(CASSCF+MP2)方法,和其它程序的CASPT2、MR-MP2等方法的结果是不一样的。

6. Douglas-Kroll标量相对论计算。大多数程序使用点核模型,Gaussian使用更精确的Gaussian有限核模型。对于重元素体系的计算,总能量有显著差别。

7. 对于Post-HF计算,冻结轨道设置不同。Gaussian默认冻结全部芯轨道。如果HF参考能量相同,但Post-HF能量不同,可能就是这个原因。

8. 指定的或程序猜测的占据轨道不同。

9. 其它原因,如做了近似(如密度拟合,局域化轨道),程序BUG,输入错误,等。

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:37 ]
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子

学习了,不错。
愿好运与快乐伴随你!
2楼2009-11-13 09:56:53
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zhou2009

版主 (著名写手)

学习了,受益了!
3楼2009-11-13 14:15:44
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blsas

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
能具体说一下PBE0和PBEPBE1的区别吗? 谢谢
4楼2009-11-13 21:17:19
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

我用n个程序重新检查了pbe0/pbe1pbe的结果,发现只有molpro的pbe0能量和其他程序不一致。因此不是gaussian的问题。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
5楼2009-11-14 00:22:30
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blsas

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
比较了一下手上的程序包,Turbomole和Gaussian是一致的, molpro是不同的。
Turbomole的说明是(和Gaussian对应的文献JCP, 110,6158 (1999)相同)

         ------------------
          density functional
          ------------------
PBE0 hybrid functional
exchange:    3/4 (LDA+PBE) + 1/4 HF
correlation: LDA (PW) + PBE
spherical integration : Lebedev's spherical grid
spherical gridsize    :            5
   i.e. gridpoints    :          590
value for diffuse not defined
radial integration    : Chebyshev 2nd kind (scaling 3)
radial gridsize       :            8
integration cells     :            1
partition function    : becke
partition sharpness   :            3
.....

molpro手册的说明是PBE0 = 0.25d0 EXACT + 0.75d0 PBEX + PW91C

可能是相关泛函不同,不知道molpro为什么这么定义PBE0........
6楼2009-11-14 03:08:05
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psfan

铁虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这么说量化领域,细微的计算差别是这种混乱造成的
7楼2009-11-15 07:15:20
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bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
注意读一下gaussian公司的版权申明,它不允许将它结果与其它的软件的结果进行比较,在这里说说没问题,但不能写在文章里。
8楼2010-04-17 23:06:25
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