24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1253  |  回复: 10
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wanfei

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】BSSE基组重叠误差校正,输入格式,分子说明部分

BSSE基组重叠误差校正,输入格式,分子说明部分,我想计算儿茶素-(H2O)2和儿茶素-H2O的BSSE基组重叠误差,不 知道怎么 输入格式,在 网上看到C2 +  NO --> C2NO  

0 2 0 1 0 2
C        0.000000    1.600184    0.000000 1
C        0.000000    0.960265    0.000000 1
N        0.208401    3.031919    0.000000 2
O        1.164068    3.666273    0.000000 2

0 2 0 1 0 2分别代表总体系电荷和多重度,片段一的电荷和多重度,片段二的电荷和多重度。可是 不 知道怎么将高斯的out文件的 坐标 改为上面 坐标的 形式,另外如果是两个水,为什么两个水 的坐标不 同,希望高手 指点 ,由于初学者,希望说的 具体点,谢谢

[ Last edited by cadick on 2009-12-12 at 01:03 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanfei

金虫 (小有名气)


fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流2 12-13 17:04
我输入的 儿茶素-H2O 文件是
%chk=2.chk

# b3lyp/6-31g* counterpoise=2

1

0 2 0 1 0 2
H                 -0.06271600   -0.06679000   -0.05851700 2
C                 -0.04691300    0.00160100    1.02859600 2
O                  2.37043700    0.18857200    0.97671700 2
C                 -1.24545600   -0.04054300    1.73586000 2
C                  1.17318100    0.15580600    1.68044700 2
H                  2.16719000    0.22726000    0.02975100 2
C                 -1.23582000    0.05967100    3.14686500 2
C                  1.21068500    0.29095300    3.08634000 2
H                 -2.17930000   -0.06601400    1.18490100 2
C                 -2.45731900    0.00662600    3.93285800 2
C                  0.00662500    0.23678600    3.78862500 2
O                  2.34068600    0.45508400    3.80802800 2
O                 -2.34826300    0.63602700    5.16385700 2
H                  0.05468500    0.33575800    4.86631500 2
C                 -3.64175200   -0.67507200    3.62877100 2
H                  3.16023700    0.53134200    3.26205900 2
C                 -3.41547600    0.74289000    6.01467900 2
C                 -4.74115200   -0.61992400    4.47608500 2
O                 -3.76308600   -1.44075400    2.49780700 2
C                 -3.20272500    1.44334300    7.19393300 2
C                 -4.65586000    0.15066100    5.68133600 2
H                 -5.60176200   -1.23376100    4.23175800 2
H                 -2.87227600   -1.65467700    2.17226200 2
C                 -4.27000200    1.57656400    8.08676300 2
C                 -5.71413200    0.33743600    6.60118100 2
H                 -2.23519900    1.87729900    7.41477800 2
C                 -5.52533100    1.03335400    7.79232700 2
O                 -4.03244800    2.26955700    9.23916400 2
O                 -6.96314200   -0.16797500    6.36871300 2
O                  4.71958700    0.42094300    2.41330600 1
H                 -6.36763200    1.15193500    8.46819600 2
H                 -7.02854900   -0.43691400    5.43969300 2
H                  5.04670400   -0.46072900    2.65090500 1
H                 -4.84674500    2.29275700    9.76532100 2
H                  4.18777000    0.27986800    1.60819100 1
结果总是错误,
********************************************
Gaussian 98:  x86-Win32-G98RevA.7 11-Apr-1999
                  13-Nov-2009
*********************************************
%chk=2.chk
Default route:  MaxDisk=2000MB
-----------------------------
# b3lyp/6-31g* counterpoise=2
-----------------------------
  QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE.
# B3LYP/6-31G* COUNTERPOISE=2           
                '
Last state="GCL"
TCursr=  910 LCursr=  15
Error termination via Lnk1e in d:\G98W\l1.exe.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    6 Int=    0 D2E=    0 Chk=   13 Scr=    1
怎么改啊,另外计算出来的out文件怎么分析,谢谢了
8楼2009-11-13 20:00:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

jyzhao1981

木虫 (正式写手)

★ ★
zeoliters(金币+1,VIP+0):谢谢回帖交流! 11-12 17:05
wanfei(金币+1,VIP+0):谢谢 你 帮忙 解决 问题 11-13 17:09
用gview保存一下,要选中write cartersians
人生需要多少等待?
2楼2009-11-12 22:59:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zeoliters

木虫 (正式写手)

★ ★
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流! 11-13 12:38
wanfei(金币+1,VIP+0):坐标问题 解决 了,谢谢 11-13 17:18
楼上已经讲的比较清楚了,先去试试。
没看懂这句话是什么意思:
“另外如果是两个水,为什么两个水 的坐标不 同,希望高手 指点 ”
3楼2009-11-13 00:08:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★ ★ ★
mingdong(金币+3,VIP+0):感谢交流! 11-13 12:38
1、不是修改out文件,要修改gjf文件。
2、gview保存文件的时候,选择存储笛卡尔坐标,而不是内坐标。
3、两个水分子位置不同,当然坐标不同。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2009-11-13 12:04:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 河北省自然科学基金 +5 Peterchao 2026-05-18 8/400 2026-05-24 11:58 by 晓晓爱翠翠
[教师之家] 论文撤稿了 +3 bjvtcliu 2026-05-24 5/250 2026-05-24 10:06 by Equinoxhua
[教师之家] 某211大学教师把个人教师官方主页改成:我跑了我跑了我跑了!官宣跑路! +4 zju2000 2026-05-21 5/250 2026-05-24 09:35 by songwz
[考博] 26/27申博自荐 10+4 ZXW0202 2026-05-22 9/450 2026-05-24 08:47 by bjvtcliu
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hvkbtfonbv 2026-05-23 3/150 2026-05-24 08:01 by 9ps9vgkqva
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 pmo95bazuy 2026-05-23 7/350 2026-05-24 06:35 by fpo5ljpv91
[基金申请] 揭秘青基评审内幕:几个A才能顺利中标 +3 国自然国社科中 2026-05-23 4/200 2026-05-23 15:37 by 2000zf36392
[基金申请] 青B发送上会通知了吗 +5 chemBioBro 2026-05-22 7/350 2026-05-23 12:35 by zhuifengzhy
[考博] 博士申请 +3 焦晓明 2026-05-21 3/150 2026-05-23 11:26 by mlc840311
[论文投稿] 投稿求助,期刊 +4 希冀,有书读 2026-05-20 8/400 2026-05-22 10:16 by 希冀,有书读
[文学芳草园] 献血感触 +7 呀呀好傻 2026-05-19 13/650 2026-05-21 20:15 by 呀呀好傻
[基金申请] 面上本子正文33页,违规吗?会被低分嘛? +14 1234567wang 2026-05-17 16/800 2026-05-21 17:58 by 脆脆的饼干
[基金申请] 国自然评分 +4 无名者登山 2026-05-20 5/250 2026-05-21 16:35 by swuq
[基金申请] 国自然上会要求 +7 无名者登山 2026-05-18 11/550 2026-05-21 15:50 by draco1987
[基金申请] 提交了我也来说说感想 +9 fummck 2026-05-20 10/500 2026-05-21 14:17 by draco1987
[基金申请] 评审有感 +15 popular289 2026-05-18 26/1300 2026-05-21 10:35 by 西葫芦炒鸡蛋
[有机交流] 反应很差,大量原料没有反应 5+3 Mr.Zot 2026-05-19 8/400 2026-05-20 22:19 by Equinoxhua
[考博] 如果工作了想读博,可以边工作边读全日制嘛? 30+3 铁达火车 2026-05-18 5/250 2026-05-20 09:33 by tfang
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
信息提示
请填处理意见