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bbslover

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[交流] 【讨论】描述符太多了，处理后剩下200个，能行吗？

原始600个描述符，去除恒值，去除零值个数占90%的描述符，去除sd<0.5的描述符后还剩下200个，接下来用这200个进行主成份分析得出主成份在进行回归可以吗？还有更好的方法把这200个描述符进一步减少呢？

[ Last edited by zeoliters on 2009-11-13 at 17:33 ]

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1楼 2009-11-12 09:36:26

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yinjj

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zeoliters(金币+2,VIP+0):谢谢回帖交流！ 11-12 17:15

当然还有其它方法了，如简单的fisher法、熵法........复杂的如遗传算法、决策树之类的....................不管用什么方法，选择出来的decriptors一定要有物理意义，且要具有可解释性，这样建立的QSAR/QSPR在理论才有一定的意义啊！

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独立之精神，自由之思想！

2楼2009-11-12 19:16:22

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bbslover

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引用回帖:

Originally posted by yinjj at 2009-11-12 19:16:
当然还有其它方法了，如简单的fisher法、熵法........复杂的如遗传算法、决策树之类的....................不管用什么方法，选择出来的decriptors一定要有物理意义，且要具有可解释性，这样建立的QSAR/QSPR在理论 ...

那是不是说，不管用什么方法，选出来的描述符对training set 和test set都有好的统计结果，且可以解释，就可以啊？比如说，我随便自己瞎选几个，恰巧碰上了这几过效果好，也好解释，就行。呵呵，这是极端说法了。写文章时候没有依据。

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3楼2009-11-14 01:41:00

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