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是否清楚Western Blot中 浓缩胶和分离胶的区别与作用
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是否清楚Western Blot中 浓缩胶和分离胶的区别与作用
1什么是Western blot?蛋白质免疫印迹是分子生物学实验中常用的技术,通过电泳分离蛋白、转膜后利用抗体特异性结合来检测样品中目标蛋白质的技术。主要步骤包括:①电泳分离(使用凝胶把混合蛋白按分子量大小分开,就是我们今天聊的环节);②转膜(把凝胶上的蛋白“转移”到硝酸纤维素膜或PVDF膜等载体上);③孵育(用特异性抗体孵育目的蛋白);④显影(通过化学发光等方式让目的蛋白显现形成清晰条带)。 而完成这一切的前提,就是①电泳能把蛋白清晰的分开,也就是需要使用到分离胶,使用分离胶我们可以很好的理解,但是实验过程还需要浓缩胶的配合,那么为什么呢?
2分离胶与浓缩胶的成分差异
3浓缩胶的作用浓缩胶,顾名思义,就是将蛋白样本进行浓缩,使得样本孔中的蛋白质样本压缩到一条窄窄的起跑线,确保所有的样本同时进入分离胶分离。为什么它能做到浓缩这一点呢?首先浓缩胶的浓度通常很低(一般为5%),所以对应的凝胶孔径大;其次,浓缩胶的pH值通常为6.8,而分离胶是8.8,这种pH差异源于两者缓冲液成分的不同——浓缩胶用Tris-HCl(pH6.8),分离胶用Tris-HCl(pH8.8)在电泳的时候,缓冲液里的氯离子(Cl⁻)是跑得最快,甘氨酸(在pH6.8环境中解离少,带电荷少)是跑得较慢,而蛋白质介于两者之间。当电场启动后,氯离子快速向前冲,甘氨酸慢悠悠跟在后面,两者之间形成一个“低离子浓度区”。蛋白质会被这个“浓度差”推着向前,逐渐聚集到氯离子和甘氨酸之间的“夹缝”里,原本分散在孔里的样品,就被压缩成了一条极窄的条带。
4分离胶的作用分离胶,顾名思义,就是用来分离蛋白的啦。分离胶浓度更高(8%-15%),孔径更小。成分上,丙烯酰胺与甲叉双丙烯酰胺总用量高于浓缩胶(缩小孔径),缓冲液为pH8.8的Tris-HCl(维持分离环境)。这种小孔径结构形成分子筛效应:小分子蛋白易穿过孔径,迁移至凝胶下方;大分子蛋白受阻,停留于上方,实现按分子量排序分离。此外pH8.8的碱性环境还能让甘氨酸大量解离为带负电的甘氨酸根,移动速度超过蛋白质,使蛋白失去“推动”作用,仅靠自身电荷和分子筛效应迁移。
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