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汕头大学海洋科学接受调剂
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 请问下面的引物怎么理解

5’-TT(C/T)TTGGIAA(C/T)AA(A/G)AC(A/G/C/T)TA(C/T)GA-3'
1、该怎么理解呢??
2、如果自己要引物公司做的话该怎么做?做几条呢??
我怎么觉得这是好几条呢??还是随意选择其中的一条就可以呢??

请大家帮忙。谢谢
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红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子

★ ★ ★
zcqcau(金币+3,VIP+0):谢谢啊,真心谢谢 11-10 17:18
你给公司提交的时候 就写
5’-TTYTTGGIAAYAARACNTAYGA-3'
这样的话他就会合成你要的引物了
其中的Y R N代表括号里面的三种情况 公司给你合成的引物肯定不止一条吧,里面有的是5’-TT(C)TTGGIAA(C/T)AA(A/G)AC(A/G/C/T)TA(C/T)GA-3'
有的是5’-TT(T)TTGGIAA(C/T)AA(A/G)AC(A/G/C/T)TA(C/T)GA-3'
后面的括号排列组合就好,你确认一下啊简并性字母的对应是不是正确的,我们都是在上海生工合成的,比较快

D 表示 A G T
V   表示     A G C
Y    表示    C T
H    表示    A C T
R     表示   A G
N     表示   ACGT
W    表示   A T
K    表示    G T
可以用QQ找我……
7楼2009-11-10 17:14:50
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红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子


1949stone(金币+1,VIP+0): 11-10 17:04
这是简并引物啊,你直接提交合成公司就可以了,(c/t)(a/g)有自己单独的代码,送合成的时候注意一点就好了
可以用QQ找我……
2楼2009-11-10 16:40:41
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fykxy_206

木虫 (正式写手)

★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢交流 11-10 17:04
D 表示 A G T
V   表示     A G C
Y    表示    C T
H    表示    A C T
R     表示   A G
N     表示   ACGT
W    表示   A T
K    表示    G T
3楼2009-11-10 16:58:31
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 红多多 at 2009-11-10 16:40:
这是简并引物啊,你直接提交合成公司就可以了,(c/t)(a/g)有自己单独的代码,送合成的时候注意一点就好了

先谢谢高手,这的确是简并引物,可是麻烦您能说的明白点吗??譬如这总共代表着多少个碱基呢??
到时候我把这样的序列给公司,他就能合成出这样的引物吗??
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4楼2009-11-10 17:00:04
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