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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请问下面的引物怎么理解
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 请问下面的引物怎么理解

5’-TT(C/T)TTGGIAA(C/T)AA(A/G)AC(A/G/C/T)TA(C/T)GA-3'
1、该怎么理解呢？？
2、如果自己要引物公司做的话该怎么做？做几条呢？？
我怎么觉得这是好几条呢？？还是随意选择其中的一条就可以呢？？

请大家帮忙。谢谢
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1楼 2009-11-10 16:36:42
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红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子
★
1949stone(金币+1,VIP+0): 11-10 17:04
这是简并引物啊，你直接提交合成公司就可以了，（c/t）(a/g)有自己单独的代码，送合成的时候注意一点就好了
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可以用QQ找我……
2楼2009-11-10 16:40:41
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fykxy_206

木虫 (正式写手)
★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢交流 11-10 17:04
D 表示 A G T
V   表示     A G C
Y    表示    C T
H    表示    A C T
R     表示   A G
N     表示   ACGT
W    表示   A T
K    表示    G T
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3楼2009-11-10 16:58:31
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 红多多 at 2009-11-10 16:40:
这是简并引物啊，你直接提交合成公司就可以了，（c/t）(a/g)有自己单独的代码，送合成的时候注意一点就好了

先谢谢高手，这的确是简并引物，可是麻烦您能说的明白点吗？？譬如这总共代表着多少个碱基呢？？
到时候我把这样的序列给公司，他就能合成出这样的引物吗？？
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4楼2009-11-10 17:00:04
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红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子
★ ★ ★
1949stone(金币+1,VIP+0):真不错 我清楚了 11-10 17:05
zcqcau(金币+2,VIP+0):希望能继续回答～～谢谢 11-10 17:07
22个碱基的引物啊，括号里面的算一个，到时候公司给你合成的样品是包括括号里面每种情况的引物，但总长度都是22个。不知道我说清楚没 表达能力有限
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5楼2009-11-10 17:03:52
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 红多多 at 2009-11-10 17:03:
22个碱基的引物啊，括号里面的算一个，到时候公司给你合成的样品是包括括号里面每种情况的引物，但总长度都是22个。不知道我说清楚没 表达能力有限

那到时候是不是意味着我在做实验的时候要把这些每种情况的引物都加到里面，然后PCR呀？？还是每种单一的做一次PCR，最后比较之间的不同？？

我付钱的话是给一条引物的呢？？还是这么多条呢？？

本人生物知识有限，请高人耐心解答，真诚谢谢
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6楼2009-11-10 17:07:25
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红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子
★ ★ ★
zcqcau(金币+3,VIP+0):谢谢啊，真心谢谢 11-10 17:18
你给公司提交的时候 就写
5’-TTYTTGGIAAYAARACNTAYGA-3'
这样的话他就会合成你要的引物了
其中的Y R N代表括号里面的三种情况 公司给你合成的引物肯定不止一条吧，里面有的是5’-TT(C)TTGGIAA(C/T)AA(A/G)AC(A/G/C/T)TA(C/T)GA-3'
有的是5’-TT(T)TTGGIAA(C/T)AA(A/G)AC(A/G/C/T)TA(C/T)GA-3'
后面的括号排列组合就好，你确认一下啊简并性字母的对应是不是正确的，我们都是在上海生工合成的，比较快

D 表示 A G T
V   表示     A G C
Y    表示    C T
H    表示    A C T
R     表示   A G
N     表示   ACGT
W    表示   A T
K    表示    G T
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7楼2009-11-10 17:14:50
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fykxy_206

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zcqcau at 2009-11-10 17:07:

那到时候是不是意味着我在做实验的时候要把这些每种情况的引物都加到里面，然后PCR呀？？还是每种单一的做一次PCR，最后比较之间的不同？？

我付钱的话是给一条引物的呢？？还是这么多条呢？？

本人生物知 ...

插句话啊 ，我觉得这些兼并引物就是在合成的时候是很多条的引物在一起的混合引物，有兼并引物的地方的碱基不同，其他的相同。你PCR的时候就只加这“混合引物”就可以了。
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8楼2009-11-10 17:17:08
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)
希望楼主给fykxy_206 加1个金币，从我的金币里面扣除。谢谢。
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9楼2009-11-10 17:20:33
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fykxy_206

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zcqcau at 2009-11-10 17:20:
希望楼主给fykxy_206 加1个金币，从我的金币里面扣除。谢谢。

不为金币，相互学习。
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10楼2009-11-10 17:34:29
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