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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】nose 方法控温出现问题
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043114076

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】nose 方法控温出现问题

本人是新手。在用NPT系综下用discover进行动力学模拟。使用Nose方法来控温，目标温度298K。温度一开始时还能保持平稳，在298K，但10000步左右温度开缓慢上升，在40000步左右温度飙升，然后软件报错，任务失败。我的Q ratio 使用默认1.0。不知应该怎样改设置，希望高手指点。

[ Last edited by woshilsh on 2009-11-13 at 22:30 ]
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1楼 2009-11-09 19:11:01
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guosy1999

木虫 (正式写手)

中纪委反2协会督导员
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 11-10 11:04
建议使用NVT系综，这样可以避免压力的设置，，呵呵，投机一下
NOSE温控方法中，一般就使用Q=1的，这个一般不用改。。
书上讲Q值越大，越易达到平衡，即对于体系的平衡时可以取Q值大一点。。
具体的可以参看陈振隆的分子模拟讲义。。
赞一下(11人) 回复此楼
少年不识愁滋味，为赋新词强说愁。
3楼2009-11-10 10:50:18
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tiyang1987

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
呵呵，我也在学习discover进行动力学模拟，不过我是新手，不懂，帮你顶一下啊
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-11-09 19:48:08
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by guosy1999 at 2009-11-10 10:50:
建议使用NVT系综，这样可以避免压力的设置，，呵呵，投机一下
NOSE温控方法中，一般就使用Q=1的，这个一般不用改。。
书上讲Q值越大，越易达到平衡，即对于体系的平衡时可以取Q值大一点。。
具体的可以参看陈振 ...

谢谢，我试试
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4楼2009-11-11 10:00:43
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