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上进的小白

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何修改已经提交的PDB数据 已有1人参与

有没有大佬知道已经提交的PDB数据怎么修改呀!
之前解出来的晶体结构的序列有点问题,想修改一下,有没有大佬知道怎么操作呀,感谢!

@jackdeng @lich666 发自小木虫IOS客户端
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rlafite

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
只有原提交账号(通过登录PDB时使用的邮箱确认)或经PDB工作人员授权才能修改数据。

若你非原始提交者,需联系原团队或通过PDB帮助台(help@wwpdb.org)申请协助。

分情况处理修改请求
(1)数据未公开(Processing/On Hold状态)
直接修改:登录PDB提交系统(如ADIT、OneDep),找到对应条目(使用PDB ID或临时编号),直接编辑并重新提交。

需修改的文件:通常需更新PDB文件或mmCIF文件中的序列信息(如_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code字段)。

(2)数据已公开(Released状态)
提交修正请求:

登录PDB的OneDep系统(https://deposit.wwpdb.org/deposition/)。

选择"Modify or revise an existing entry",输入PDB ID和修改理由。

上传修正后的文件(PDB/mmCIF格式),并标注变更内容(如序列残基的更正、注释更新等)。

提交后,PDB团队会审核修改(通常需1-5个工作日)。
2楼2025-05-10 02:41:55
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