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qqsvery

木虫 (著名写手)


[资源] 【原创】发一个关于Tail PCR的操作流程!!!

这个是牛津大学植物科学系朗戴尔实验室里使用的Tail-PCR操作流程。
        ------Langdale Lab, Department of Plant Sciences, University of Oxford


顺便介绍一下Tail-PCR

Tail-PCR,即热不对称交错PCR,英文全称为:Thermal Asymmetric Interlaced PCR.能够较好地解决分离与已知RNA序列邻近的未知序列,以便基因克隆和分子杂交的探针的制备。
      
       TAIL-PCR技术简单易行,反应高效灵敏,产物的特异性高,重复性好,能够在较短的时间内获得目标片段,已经成为分子生物学研究中的一种实用技术。经改良过的TAIL-PCR成功地从突变体中克隆到外源插入基因的旁侧序列,从而为启动子的克隆提供了有效的新方法。
  在利用特异引物和随机引物进行PCR中一般有3种产物生成:
  ①由特异性引物和简并引物扩增出的产物;
  ②由同一特异性引物扩增出的产物;
  ③由同一简并引物扩增出的产物。

  在TAIL-PCR反应中,其中后2种目标产物可以通过以嵌套的特异性引物进行的后续反应来消除。TAIL-PCR的基本原理是利用目标序列旁的已知序列设计3个嵌套的特异性引物(special primer,简称sp1,sp2,sp3,约20bp),用它们分别和1个具有低Tm值的短的随机简并引物(arbitrary degenerate prime,AD,约14bp)相组合,以基因组RMA为模板,根据引物的长短和特异性的差异设计不对称的温度循环,通过分级反应来扩增特异引物。TAIL-PCR共分3次反应。

  第一次反应包括5次高特异性、1次低特异、10次较低特异性反应和12个热不对称的超级循环。5次高特异性反应,使sp1与已知的序列退火并延伸,增加了目标序列的浓度;1次低特异性的反应使简并引物结合到较多的目标序列上;10次较低特异性反应使2种引物均与模板退火,随后进行12次超级循环。经上述反应得到了不同浓度的3种类型产物:特异性产物①型和非特异性产物(②型和③型)。

  第二次反应则将第一级反应的产物稀释1000倍作为模板,通过10次热不对称的超级循环,使特异性产物被选择地扩增,而非特异产物含量极低。第三次反应又将第二次反应的产物稀释作模板,再设置普通的PCR反应或热不对称超级循环,通过上述3次PCR反应可获得与已知序列邻近的目标序列。

纳米盘下载地址:
http://d.namipan.com/d/An%20intr ... 677529f5a8e00fa0e00

[ Last edited by 三个小石子 on 2009-12-25 at 16:43 ]
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qqsvery

木虫 (著名写手)


难道就没有人做这个?还是我发的地方不对?看来我得发在生命科学版块里!

[ Last edited by qqsvery on 2009-11-6 at 21:52 ]
2楼2009-11-06 16:04:03
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点点风

荣誉版主 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

对生物工程的虫子相当有用,严重支持....
3楼2009-11-06 20:56:35
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qiuyu618

铜虫 (正式写手)


支持一下,谢谢
4楼2009-11-10 16:22:19
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qqsvery

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 点点风 at 2009-11-6 20:56:
对生物工程的虫子相当有用,严重支持....

我贴上去的附件是不收费的,怎么点开来却要一个金币,这是怎么回事?这样各位虫友就不太方便下载了。请版主去掉那个收费!
5楼2009-11-17 13:25:45
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magy2006

木虫 (著名写手)


seamuse(金币+0,VIP+0):已完成重新上传!感谢参与讨论,欢迎常来理工农林版! 12-25 18:12
根本就没有资源,愤怒
6楼2009-12-25 11:50:22
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qqsvery

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by magy2006 at 2009-12-25 11:50:
根本就没有资源,愤怒

你好~真是抱歉,我也是最近才发现,因为小木虫改版,不知道我的资源放哪里去了,我现在重新上传资源!
7楼2009-12-25 12:41:08
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qqsvery

木虫 (著名写手)


资源重新上传,抱歉啊~改版后资源丢失!

★ ★
seamuse(金币+2,VIP+0):感谢重新上传! 12-25 18:12
这个是纳米盘链接,大家注意下载啊:
http://www.namipan.com/d/An%20in ... 677529f5a8e00fa0e00
8楼2009-12-25 16:39:44
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

支持一下
9楼2009-12-25 16:47:21
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GMDGMD

捐助贵宾 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

三个小石子(金币+0,VIP+0):果然有高手,欢迎常来理工农林版指导! 12-27 11:34
说到TAIL-PCR,不是哥吹,全中国恐怕也找不到几个比哥做的多的!
10楼2009-12-27 11:23:55
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whoiam21

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by GMDGMD at 2009-12-27 11:23:
说到TAIL-PCR,不是哥吹,全中国恐怕也找不到几个比哥做的多的!

碰见高手啦,太好了

问一下随机引物如何设计,如我做的物种基因组、蛋白信息都不多,要克隆一个基因片段的5‘端序列及启动子。

请不吝指教
11楼2009-12-28 10:08:11
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